More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3746 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  97.16 
 
 		 425 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  90.95 
 
 		 444 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  84.94 
 
 		 448 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  87.81 
 
 		 444 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 		 445 aa  856    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  87.81 
 
 		 444 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  88.15 
 
 		 421 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  73.51 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  72.52 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  70.43 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  70.43 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  70.43 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  70.43 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  70.43 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  70.43 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  54.84 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  55.44 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  55.53 
 
 		 416 aa  362  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0254  Chloride channel core  36.04 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  31.83 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  31.1 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  43.59 
 
 		 504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  33.61 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  32.03 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  32.58 
 
 		 579 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.01 
 
 		 591 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.46 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.41 
 
 		 589 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  28.76 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.36 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.07 
 
 		 608 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.2 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.57 
 
 		 593 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.57 
 
 		 593 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 589 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 589 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.69 
 
 		 589 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  33.24 
 
 		 586 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  36.58 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.81 
 
 		 669 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  32.77 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.13 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.13 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.09 
 
 		 636 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  32.49 
 
 		 589 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.53 
 
 		 602 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.09 
 
 		 579 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.09 
 
 		 579 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.09 
 
 		 579 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.75 
 
 		 628 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.32 
 
 		 627 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.87 
 
 		 584 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.87 
 
 		 591 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.48 
 
 		 614 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.89 
 
 		 613 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.89 
 
 		 606 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.56 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.62 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.19 
 
 		 577 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.46 
 
 		 560 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  28.47 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  28.47 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.25 
 
 		 591 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.75 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.81 
 
 		 603 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.02 
 
 		 569 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.07 
 
 		 439 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.07 
 
 		 439 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.07 
 
 		 439 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.61 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.24 
 
 		 591 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  27.86 
 
 		 596 aa  87  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  26.17 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.16 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.72 
 
 		 582 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.08 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  25.19 
 
 		 615 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.57 
 
 		 538 aa  83.2  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  26.98 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.08 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  24.45 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  27.93 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.04 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  30.54 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.04 
 
 		 625 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  26.61 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.34 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  26.61 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  26.61 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  26.61 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  26.61 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  28.12 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  30.72 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.14 
 
 		 631 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.4 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  27.7 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  26.9 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.96 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.96 
 
 		 587 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.14 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>