More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1179 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  100 
 
 
418 aa  823    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  31.93 
 
 
427 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  33.7 
 
 
448 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  33.7 
 
 
476 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  33.7 
 
 
448 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  33.7 
 
 
504 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  33.7 
 
 
513 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  34.26 
 
 
443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 
444 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  33.42 
 
 
476 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 
444 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  35.52 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.83 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  32.49 
 
 
421 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  33.33 
 
 
420 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  31.48 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  32.71 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  29.02 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  31.93 
 
 
448 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.06 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  29.02 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  28.78 
 
 
426 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  30.21 
 
 
488 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0254  Chloride channel core  29.68 
 
 
462 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.42 
 
 
602 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.84 
 
 
598 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  26.78 
 
 
595 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  26.83 
 
 
465 aa  97.4  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.67 
 
 
589 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.55 
 
 
512 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.53 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.5 
 
 
560 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.07 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.76 
 
 
591 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.45 
 
 
628 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.74 
 
 
577 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.57 
 
 
608 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.66 
 
 
579 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.66 
 
 
579 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.66 
 
 
579 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.76 
 
 
614 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
589 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.24 
 
 
589 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.24 
 
 
589 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.66 
 
 
636 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.2 
 
 
613 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.96 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.81 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  25.77 
 
 
528 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.04 
 
 
593 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.96 
 
 
606 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.04 
 
 
593 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.39 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.33 
 
 
591 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  27.06 
 
 
579 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  26.89 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  26.89 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  26.89 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  26.89 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  26.89 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  27.12 
 
 
596 aa  84.3  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.17 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  25.17 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.17 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.62 
 
 
603 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  22.3 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.49 
 
 
617 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.51 
 
 
585 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24.38 
 
 
519 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  27.9 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.58 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27 
 
 
591 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  26.73 
 
 
579 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  24.38 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.86 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.63 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  25.26 
 
 
563 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.67 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.75 
 
 
580 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.7 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.86 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  27.22 
 
 
594 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  29.96 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  28.63 
 
 
574 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  27.7 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  25.9 
 
 
533 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  25.17 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.88 
 
 
863 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.35 
 
 
625 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  25.09 
 
 
605 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.08 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  27.03 
 
 
600 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25.33 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.3 
 
 
575 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  29.3 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.3 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.59 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  23.15 
 
 
462 aa  69.7  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  24.03 
 
 
615 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  27.9 
 
 
609 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>