More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3685 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  94.67 
 
 		 413 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  94.19 
 
 		 413 aa  755    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  92.98 
 
 		 413 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  100 
 
 		 468 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  95.4 
 
 		 413 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  99.52 
 
 		 413 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  95.4 
 
 		 413 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  77.11 
 
 		 436 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  81.57 
 
 		 435 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  81.06 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  81.06 
 
 		 436 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  81.06 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  81.06 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  80.81 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  80.81 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  80.81 
 
 		 435 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  68.37 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  68.37 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  70.71 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  61.99 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  60.46 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  61.99 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  61.06 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  61.06 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  66.58 
 
 		 440 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  47.31 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.1 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  47.38 
 
 		 452 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  49.61 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  49.76 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  50.12 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  45.54 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  52.23 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  43.53 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  43.91 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  49.62 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  42.14 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  37.4 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  33.1 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  35.73 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  32.74 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  35.81 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.59 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  35.41 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  34.91 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  34.91 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.12 
 
 		 606 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.22 
 
 		 598 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  24.15 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.05 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  31.66 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.74 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.95 
 
 		 580 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.5 
 
 		 612 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.7 
 
 		 589 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.7 
 
 		 589 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.7 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.7 
 
 		 589 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.62 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.7 
 
 		 593 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.68 
 
 		 608 aa  97.8  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.08 
 
 		 589 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.61 
 
 		 614 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.15 
 
 		 613 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.43 
 
 		 625 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.97 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.84 
 
 		 628 aa  93.2  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.11 
 
 		 591 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  28.4 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  30.75 
 
 		 634 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  30.93 
 
 		 612 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.21 
 
 		 636 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.68 
 
 		 579 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.68 
 
 		 579 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.68 
 
 		 579 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.23 
 
 		 560 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  26.29 
 
 		 582 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.7 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.55 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.57 
 
 		 591 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.39 
 
 		 587 aa  87.4  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  24.77 
 
 		 586 aa  87  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  29.52 
 
 		 640 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.4 
 
 		 612 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.85 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.59 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.53 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  35.67 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.53 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.43 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.73 
 
 		 602 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  26.58 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.31 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.89 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  27.25 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  28.75 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.92 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  27.06 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  27.06 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  32.37 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>