More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0274 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  100 
 
 		 455 aa  904    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  95.6 
 
 		 455 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  64.76 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  40.28 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  43.24 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  39.55 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  39.61 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  39.61 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  36.71 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  36.71 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  34.61 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  38.06 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  38.06 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  36.27 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  38.69 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  32.93 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  35.16 
 
 		 413 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  38.39 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  33.69 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  35.41 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  35.68 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  35.41 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.41 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.41 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  35.41 
 
 		 468 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  33.92 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  36 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  35.37 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  35.37 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  35.16 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  35.37 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  35.37 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  35.37 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.32 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  36.09 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  34.43 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  35.75 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  37.23 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.56 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  30.61 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  36.16 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  33.01 
 
 		 598 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  36.41 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  34.65 
 
 		 421 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  32.75 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  31.86 
 
 		 582 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.5 
 
 		 754 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.51 
 
 		 580 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  33.33 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  33.87 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  37.14 
 
 		 669 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.67 
 
 		 588 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.05 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  32.42 
 
 		 625 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.57 
 
 		 612 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  29.44 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  30.29 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  30.9 
 
 		 651 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.14 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  30.75 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  29.83 
 
 		 602 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  31.44 
 
 		 544 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.77 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.66 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.14 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.54 
 
 		 584 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  26.32 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.5 
 
 		 615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 		 636 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.75 
 
 		 629 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.09 
 
 		 614 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.46 
 
 		 608 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 		 579 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 		 579 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 		 579 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.68 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.24 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.22 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.06 
 
 		 569 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.92 
 
 		 626 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.98 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.52 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.43 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  29.02 
 
 		 638 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  30.81 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  30.87 
 
 		 600 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.97 
 
 		 591 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.87 
 
 		 589 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.93 
 
 		 594 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  29.55 
 
 		 612 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  29.17 
 
 		 634 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.77 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.09 
 
 		 577 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.59 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  29.56 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  30.72 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  26.93 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  30.72 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.88 
 
 		 863 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.29 
 
 		 593 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>