More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1603 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  100 
 
 
427 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  100 
 
 
427 aa  822    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  99.08 
 
 
435 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  99.08 
 
 
435 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  94.02 
 
 
435 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  99.31 
 
 
435 aa  834    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  100 
 
 
427 aa  822    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  100 
 
 
436 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  77.45 
 
 
436 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  79.31 
 
 
413 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  80.4 
 
 
413 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  80.4 
 
 
413 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  80.4 
 
 
413 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  83.33 
 
 
413 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  81.06 
 
 
468 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  81.06 
 
 
413 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  67.83 
 
 
426 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  67.83 
 
 
426 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  60.66 
 
 
431 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  61.33 
 
 
443 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  61.33 
 
 
443 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  69.04 
 
 
431 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  60.92 
 
 
452 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  60.92 
 
 
448 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  66.26 
 
 
440 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  46.15 
 
 
417 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.48 
 
 
418 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  48.28 
 
 
452 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  51.65 
 
 
415 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  48.35 
 
 
453 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  52.54 
 
 
462 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  52.31 
 
 
457 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  50.86 
 
 
482 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  43.48 
 
 
437 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  43.48 
 
 
437 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  48.87 
 
 
421 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  44.91 
 
 
438 aa  259  9e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  36.15 
 
 
435 aa  216  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.35 
 
 
481 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  33.17 
 
 
452 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  32.64 
 
 
403 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  35.51 
 
 
398 aa  207  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  35.87 
 
 
455 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  36.12 
 
 
455 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  32.83 
 
 
494 aa  187  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  35.26 
 
 
408 aa  179  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.24 
 
 
606 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  25.54 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  26.92 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.54 
 
 
598 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  31.15 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  28.17 
 
 
434 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.99 
 
 
625 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.73 
 
 
586 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.19 
 
 
580 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.92 
 
 
612 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.78 
 
 
585 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.64 
 
 
598 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.51 
 
 
628 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.51 
 
 
754 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  27.59 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.49 
 
 
579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.49 
 
 
579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.17 
 
 
636 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  27.59 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  36.84 
 
 
638 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  37.43 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  37.43 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.49 
 
 
579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.01 
 
 
593 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.98 
 
 
593 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 
589 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.86 
 
 
613 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.55 
 
 
560 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.05 
 
 
591 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.21 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 
589 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.89 
 
 
582 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 
589 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  29.1 
 
 
533 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.88 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  28.79 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.13 
 
 
602 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.01 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.6 
 
 
614 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  28.35 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  24.49 
 
 
582 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.39 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  32.79 
 
 
605 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.01 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.87 
 
 
587 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.73 
 
 
603 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  24.58 
 
 
603 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.11 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.63 
 
 
608 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.53 
 
 
591 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  26.89 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  28.07 
 
 
544 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.37 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.37 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>