238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1145 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  100 
 
 		 408 aa  799    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  59.08 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  50.66 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  43.44 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  40.56 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  36.12 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  37.37 
 
 		 437 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  37.63 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  40.44 
 
 		 482 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  34.9 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  36.68 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  33.42 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  34.43 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  34.43 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.39 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.9 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  34.18 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  34.18 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  35.84 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  37.47 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  34.7 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  39.31 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  35.26 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  35.26 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  35.66 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  35.21 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.21 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  34.93 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  35.96 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  35.77 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  35.26 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  35.26 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  35.26 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  35.26 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  35.26 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  34.01 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  35.01 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.21 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  36.26 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  34.94 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  36.16 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  29.16 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  31.27 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.89 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  30.31 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  32.37 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  26.68 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.3 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  27 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.91 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  29.51 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.13 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  29.25 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  29.25 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.6 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  24.85 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.13 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  28.57 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.98 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  27.71 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.26 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  32.55 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  28.5 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  24.75 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.56 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.56 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.11 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.11 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.46 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  30.05 
 
 		 627 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  34 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  27.19 
 
 		 598 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.52 
 
 		 594 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  27.83 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.66 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.94 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.43 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  25.77 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.2 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  28.2 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.95 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.75 
 
 		 612 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  29.26 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.6 
 
 		 598 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.84 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.27 
 
 		 591 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.03 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  34.97 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  32.33 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  25.93 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.1 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  25.93 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  27.82 
 
 		 574 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  28.9 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  25.59 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  30.56 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  25.68 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.56 
 
 		 588 aa  57  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  30.82 
 
 		 575 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>