274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1199 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  100 
 
 		 403 aa  790    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  49.34 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  50.66 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  44.25 
 
 		 435 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  37.66 
 
 		 437 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  37.15 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  35.75 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  36.32 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  35.71 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  34.37 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.16 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  36.45 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  33.68 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  33.68 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  34.91 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  34.91 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  35.51 
 
 		 482 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  34.23 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.23 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  36.46 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  35.11 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  35.11 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  33.69 
 
 		 413 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  35.42 
 
 		 431 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  32.99 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  33.24 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  35.16 
 
 		 457 aa  199  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  32.9 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  32.64 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  32.64 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  32.64 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  32.64 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  32.64 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  32.38 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.42 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  32.38 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.75 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  33.15 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  34.76 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  34.15 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  34.46 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  29.44 
 
 		 452 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  29.1 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  26.07 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  26.32 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.3 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.8 
 
 		 598 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  27.09 
 
 		 494 aa  98.2  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.8 
 
 		 613 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.62 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.49 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.06 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.46 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.95 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.95 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.13 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.95 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.95 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.47 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.06 
 
 		 606 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.85 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  38.78 
 
 		 638 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  26.17 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  37.76 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.09 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  26.33 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  26.7 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  26.7 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  37.76 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.94 
 
 		 608 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  29.14 
 
 		 528 aa  69.7  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  29.06 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  27.71 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.61 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.78 
 
 		 625 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.49 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.96 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  27.99 
 
 		 579 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  35.46 
 
 		 633 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.5 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  29.3 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  29.36 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.94 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.4 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  26.65 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25.91 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  29.07 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.34 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  23.53 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.71 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  26.57 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.82 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.85 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.09 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  28.87 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.51 
 
 		 754 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  28.12 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  28.07 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>