More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1241 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 		 428 aa  811    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  39.51 
 
 		 462 aa  276  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  38.57 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  38.66 
 
 		 586 aa  247  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  36.43 
 
 		 582 aa  229  9e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.66 
 
 		 588 aa  223  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.16 
 
 		 582 aa  206  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.41 
 
 		 754 aa  203  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  35.21 
 
 		 625 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  35.05 
 
 		 606 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.41 
 
 		 580 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  33.51 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  31.68 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  31.68 
 
 		 467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  32.27 
 
 		 602 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  30.3 
 
 		 603 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  35.39 
 
 		 544 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  34.65 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  36.01 
 
 		 651 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.37 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  34.62 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  33.25 
 
 		 605 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.32 
 
 		 612 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  32.57 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  31 
 
 		 603 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  36.12 
 
 		 605 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  30.69 
 
 		 638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  32.33 
 
 		 634 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  32.08 
 
 		 612 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.63 
 
 		 626 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  32 
 
 		 605 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  33.76 
 
 		 650 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  34.48 
 
 		 608 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.32 
 
 		 587 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.83 
 
 		 615 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.97 
 
 		 613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  30.7 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.62 
 
 		 481 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  27.57 
 
 		 598 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.75 
 
 		 603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.13 
 
 		 594 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  28.84 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.49 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.62 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.09 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.26 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  25.14 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  31.27 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  30.64 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  31.27 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  29.16 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.11 
 
 		 600 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  24.57 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.49 
 
 		 613 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.9 
 
 		 669 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.52 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  30.22 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.57 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  31.28 
 
 		 627 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.68 
 
 		 628 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.67 
 
 		 593 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.88 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.94 
 
 		 589 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 636 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.33 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  30.49 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.4 
 
 		 593 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  28.87 
 
 		 453 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.36 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  30.27 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  30.19 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  30.27 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  30.1 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  29.84 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 		 577 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  30.19 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  30.13 
 
 		 519 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  32.13 
 
 		 531 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.84 
 
 		 617 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.55 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  28.4 
 
 		 597 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  29.19 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.2 
 
 		 631 aa  97.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  30.88 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  30.59 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  30.88 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.88 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  30.31 
 
 		 461 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  30.31 
 
 		 461 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.8 
 
 		 519 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.76 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  30.29 
 
 		 413 aa  93.6  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  31.2 
 
 		 482 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  30.07 
 
 		 596 aa  93.2  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.91 
 
 		 591 aa  93.2  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>