More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3129 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  99.79 
 
 
474 aa  929    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  100 
 
 
467 aa  931    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  35.36 
 
 
598 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  34.38 
 
 
586 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  33.91 
 
 
462 aa  230  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  33.94 
 
 
582 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.62 
 
 
582 aa  206  7e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.07 
 
 
588 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.88 
 
 
580 aa  196  7e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.59 
 
 
754 aa  190  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.31 
 
 
606 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  30.34 
 
 
602 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  29.05 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  34.89 
 
 
544 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.68 
 
 
428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.08 
 
 
625 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  31.95 
 
 
453 aa  166  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  31.52 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.16 
 
 
612 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  31.11 
 
 
605 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  30 
 
 
651 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  28.84 
 
 
638 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.16 
 
 
603 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  29.46 
 
 
634 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  29.46 
 
 
612 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  30.91 
 
 
605 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.49 
 
 
613 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.74 
 
 
614 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.78 
 
 
603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  29.18 
 
 
650 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  31.21 
 
 
605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.17 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.7 
 
 
612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.71 
 
 
605 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.27 
 
 
608 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.46 
 
 
598 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.86 
 
 
627 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  27.45 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.27 
 
 
589 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  26.61 
 
 
429 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.91 
 
 
591 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.94 
 
 
426 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  26.65 
 
 
631 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.31 
 
 
584 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.74 
 
 
582 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.33 
 
 
473 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.33 
 
 
473 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.33 
 
 
473 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.33 
 
 
473 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.79 
 
 
577 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.33 
 
 
473 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  27.01 
 
 
626 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.77 
 
 
613 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.18 
 
 
593 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.84 
 
 
593 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.7 
 
 
636 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.17 
 
 
615 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.69 
 
 
569 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.7 
 
 
579 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.7 
 
 
579 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.7 
 
 
579 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.62 
 
 
594 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.4 
 
 
628 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.78 
 
 
589 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.78 
 
 
589 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.78 
 
 
589 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.42 
 
 
471 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 
591 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  29.47 
 
 
606 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.97 
 
 
624 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  28.25 
 
 
633 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.36 
 
 
510 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  28.54 
 
 
628 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.92 
 
 
587 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.27 
 
 
620 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.38 
 
 
575 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25.29 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  26.4 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  26.92 
 
 
627 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25 
 
 
598 aa  97.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.49 
 
 
617 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  29.02 
 
 
593 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.03 
 
 
519 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.5 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.7 
 
 
600 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.19 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.4 
 
 
629 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  27.42 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  27.42 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  28.45 
 
 
603 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.03 
 
 
519 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.19 
 
 
426 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  31.02 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  28.3 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  28.3 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  28.57 
 
 
598 aa  93.2  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  28.28 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  25.59 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  27.25 
 
 
494 aa  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  28.37 
 
 
604 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>