More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2668 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  76.32 
 
 
460 aa  657    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  100 
 
 
481 aa  943    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  71.01 
 
 
450 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  65.41 
 
 
452 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  64.07 
 
 
452 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  61.42 
 
 
452 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  63.84 
 
 
452 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  64.72 
 
 
452 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  63.39 
 
 
452 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.56 
 
 
863 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.33 
 
 
863 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2187  hypothetical protein  64.52 
 
 
160 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.49 
 
 
859 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.28 
 
 
862 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.39 
 
 
875 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.96 
 
 
897 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  31.76 
 
 
879 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  31.76 
 
 
879 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.3 
 
 
466 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.63 
 
 
473 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.41 
 
 
473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.41 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.41 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.41 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.12 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  32.07 
 
 
859 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  26.72 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.33 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.19 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.19 
 
 
478 aa  126  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.19 
 
 
478 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  29.97 
 
 
533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.61 
 
 
598 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 
591 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.35 
 
 
606 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  28.02 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.04 
 
 
598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.31 
 
 
519 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.21 
 
 
593 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.71 
 
 
538 aa  115  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.02 
 
 
625 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.61 
 
 
593 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.58 
 
 
628 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  27.33 
 
 
468 aa  114  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.06 
 
 
519 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.67 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.67 
 
 
589 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.67 
 
 
589 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.3 
 
 
526 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.14 
 
 
636 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26 
 
 
579 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26 
 
 
579 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26 
 
 
579 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.43 
 
 
439 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.43 
 
 
439 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  28.43 
 
 
439 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.34 
 
 
577 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  27.63 
 
 
510 aa  108  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.89 
 
 
629 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  29.11 
 
 
472 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  27 
 
 
467 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.48 
 
 
615 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.7 
 
 
614 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.99 
 
 
608 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  30.71 
 
 
456 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  25.9 
 
 
631 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.64 
 
 
523 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.32 
 
 
669 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  27.19 
 
 
523 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  26.95 
 
 
516 aa  103  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.91 
 
 
603 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  25.4 
 
 
510 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.6 
 
 
591 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  31.13 
 
 
436 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  27.59 
 
 
466 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.32 
 
 
626 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  29.36 
 
 
435 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  26.05 
 
 
518 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.11 
 
 
613 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 
591 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.8 
 
 
528 aa  99  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.01 
 
 
569 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  30.18 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  26.87 
 
 
640 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  24.93 
 
 
512 aa  98.6  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  22.59 
 
 
563 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.92 
 
 
597 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  30.09 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.25 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.2 
 
 
470 aa  95.1  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.59 
 
 
585 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  27.21 
 
 
473 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.67 
 
 
587 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  24.18 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  26.29 
 
 
455 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.75 
 
 
439 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  26.93 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  26.93 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  26.93 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>