219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_2187 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  99.38 
 
 		 452 aa  313  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  69.62 
 
 		 452 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  70.32 
 
 		 452 aa  223  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  69.68 
 
 		 452 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  68.39 
 
 		 452 aa  220  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  64.56 
 
 		 450 aa  213  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  62.66 
 
 		 460 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  62.58 
 
 		 452 aa  206  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  64.52 
 
 		 481 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  37.58 
 
 		 862 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  38.03 
 
 		 875 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.77 
 
 		 859 aa  87.8  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.68 
 
 		 879 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.68 
 
 		 879 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.89 
 
 		 863 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.05 
 
 		 897 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.05 
 
 		 863 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 577 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.63 
 
 		 589 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  31.43 
 
 		 467 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.97 
 
 		 598 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 		 636 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 591 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.06 
 
 		 471 aa  70.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.2 
 
 		 669 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.33 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  32.56 
 
 		 466 aa  68.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  35.71 
 
 		 456 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.03 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 589 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 589 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 589 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 593 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 593 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  31.01 
 
 		 468 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  30.77 
 
 		 427 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  30.77 
 
 		 427 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  30.97 
 
 		 859 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  38.24 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  26.71 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  33.06 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  26.71 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  37 
 
 		 597 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  31.54 
 
 		 478 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  31.54 
 
 		 478 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  31.54 
 
 		 478 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  31.94 
 
 		 473 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  30.67 
 
 		 533 aa  60.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  31.25 
 
 		 473 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  34.31 
 
 		 608 aa  60.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.93 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.71 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.5 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  33.33 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  33.96 
 
 		 468 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.52 
 
 		 614 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  30.34 
 
 		 594 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  34.15 
 
 		 603 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  35.34 
 
 		 598 aa  57.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  39.47 
 
 		 456 aa  57.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  37.3 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  31.82 
 
 		 510 aa  57.4  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.53 
 
 		 519 aa  57.4  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  31.09 
 
 		 631 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.85 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.25 
 
 		 569 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  35.11 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.79 
 
 		 591 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.03 
 
 		 613 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  29.31 
 
 		 510 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  25.22 
 
 		 633 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  28.49 
 
 		 651 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  30.84 
 
 		 424 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  24.18 
 
 		 595 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.63 
 
 		 598 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  32.86 
 
 		 534 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37468  ClC family transporter: chloride ion channel  28.47 
 
 		 534 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00257506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  31.58 
 
 		 612 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  31.58 
 
 		 638 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  31.58 
 
 		 634 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  27.5 
 
 		 471 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  32.41 
 
 		 625 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>