More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4594 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4594  DNA primase  100 
 
 		 632 aa  1282    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  36.73 
 
 		 623 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  40.75 
 
 		 656 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  35.12 
 
 		 636 aa  233  7.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  32.98 
 
 		 640 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.15 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  27.21 
 
 		 599 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  30.84 
 
 		 640 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  27.93 
 
 		 662 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  35.85 
 
 		 616 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 604 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  37.89 
 
 		 629 aa  220  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  28.33 
 
 		 539 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.14 
 
 		 645 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  32.11 
 
 		 600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  33.93 
 
 		 605 aa  218  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  33.97 
 
 		 629 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  32.35 
 
 		 576 aa  217  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  32.65 
 
 		 651 aa  216  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.26 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  29.67 
 
 		 595 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  39.77 
 
 		 629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  31.53 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.76 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.04 
 
 		 598 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  32.5 
 
 		 658 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.81 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.81 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.81 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.81 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.04 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.81 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  33.02 
 
 		 624 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  37.68 
 
 		 628 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.81 
 
 		 571 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  29.02 
 
 		 575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  32.06 
 
 		 595 aa  213  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  33.33 
 
 		 601 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  34.82 
 
 		 652 aa  213  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.81 
 
 		 598 aa  213  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  31.72 
 
 		 574 aa  213  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  32.24 
 
 		 667 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.44 
 
 		 595 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  31.18 
 
 		 617 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  32.86 
 
 		 660 aa  212  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  37.53 
 
 		 643 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  35.61 
 
 		 587 aa  212  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  29.96 
 
 		 653 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  34.44 
 
 		 595 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  31.42 
 
 		 598 aa  212  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  37.28 
 
 		 643 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.11 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  38.24 
 
 		 646 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  31.63 
 
 		 578 aa  211  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  33.33 
 
 		 594 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  37.32 
 
 		 655 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  31.94 
 
 		 574 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.97 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  31.93 
 
 		 587 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  29.8 
 
 		 605 aa  211  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  29.8 
 
 		 605 aa  211  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  31.79 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  32.1 
 
 		 574 aa  211  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  31.94 
 
 		 574 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  31.94 
 
 		 574 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  210  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.97 
 
 		 581 aa  210  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  32.68 
 
 		 574 aa  210  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  37.63 
 
 		 634 aa  209  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  35.07 
 
 		 621 aa  209  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  31.72 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  34.8 
 
 		 657 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  29.82 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  29.92 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.7 
 
 		 663 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  30.1 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  31.08 
 
 		 575 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  32.82 
 
 		 574 aa  209  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  33.49 
 
 		 584 aa  209  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  34.97 
 
 		 648 aa  209  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  30.89 
 
 		 645 aa  208  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.1 
 
 		 584 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  31.94 
 
 		 632 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  31.57 
 
 		 574 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.81 
 
 		 703 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  37.27 
 
 		 633 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  30.39 
 
 		 614 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  31.58 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.73 
 
 		 582 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.77 
 
 		 576 aa  207  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  31.97 
 
 		 694 aa  206  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  36.03 
 
 		 680 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  36.81 
 
 		 644 aa  207  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  33.26 
 
 		 641 aa  206  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>