More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31093 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  42.07 
 
 		 1062 aa  813    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  41.79 
 
 		 1114 aa  848    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  44.48 
 
 		 1093 aa  893    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  100 
 
 		 1094 aa  2283    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  44.18 
 
 		 1086 aa  904    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 977 aa  498  1e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 950 aa  439  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 945 aa  419  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 983 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 966 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 962 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 945 aa  400  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 955 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 955 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 952 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 945 aa  388  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 955 aa  386  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 932 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 924 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 955 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 946 aa  379  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 944 aa  375  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 926 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 925 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 969 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 938 aa  369  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 926 aa  359  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 939 aa  356  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 938 aa  342  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  26.33 
 
 		 934 aa  298  5e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 906 aa  90.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 882 aa  80.9  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 930 aa  79.7  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 904 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 829 aa  69.7  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 825 aa  65.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 979 aa  63.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 808 aa  62  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  22.92 
 
 		 883 aa  61.6  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 		 865 aa  60.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 		 865 aa  61.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4095  valyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 880 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 865 aa  60.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  22.04 
 
 		 941 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 		 947 aa  60.1  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 		 968 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0533  valyl-tRNA synthetase  22.15 
 
 		 942 aa  59.3  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535322  normal  0.45531 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2683  valyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 947 aa  58.9  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1830  leucyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 885 aa  58.9  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000180748 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 886 aa  58.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 928 aa  58.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  21.75 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 802 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1572  leucyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 		 822 aa  58.5  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.940806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03865  methionyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07820)  37.08 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 886 aa  58.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 921 aa  57.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  25.1 
 
 		 836 aa  57.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1197  leucyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 934 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 801 aa  57  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 828 aa  57  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 908 aa  57  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  22.52 
 
 		 824 aa  57  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  22.52 
 
 		 824 aa  57.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0386  valyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 951 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 481 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2216  valyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 970 aa  56.2  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832976 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 819 aa  55.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  20.88 
 
 		 973 aa  55.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  21.75 
 
 		 954 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6239  valyl-tRNA synthetase  21.63 
 
 		 881 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 806 aa  55.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 886 aa  55.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 858 aa  55.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2799  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 959 aa  55.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 830 aa  55.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 481 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1419  valyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 		 955 aa  55.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 		 959 aa  55.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3650  valyl-tRNA synthetase  21.39 
 
 		 951 aa  55.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.227036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2411  leucyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 734 aa  55.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 481 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3722  valyl-tRNA synthetase  21.18 
 
 		 951 aa  54.7  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12918  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1209  putative leucyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 734 aa  54.7  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1134  putative leucyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 734 aa  54.7  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0645  valyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 		 870 aa  55.1  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 816 aa  54.7  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 889 aa  54.7  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0094  valyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 		 994 aa  54.7  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02657  valyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 980 aa  54.7  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 1016 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 955 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>