More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0568 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 955 aa  661    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 966 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 938 aa  636    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 952 aa  657    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 962 aa  668    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 955 aa  656    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 950 aa  714    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 955 aa  661    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 983 aa  672    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 926 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 977 aa  1990    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 925 aa  634  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 945 aa  634  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 946 aa  630  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 945 aa  628  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 945 aa  629  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 944 aa  625  1e-177  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 955 aa  610  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 932 aa  599  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 924 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 926 aa  594  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 969 aa  587  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 939 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 938 aa  533  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  32.23 
 
 		 1086 aa  480  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  30.57 
 
 		 934 aa  463  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  33.75 
 
 		 1093 aa  466  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  32.78 
 
 		 1114 aa  456  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  36.28 
 
 		 1094 aa  450  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  31.27 
 
 		 1062 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 		 882 aa  185  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 809 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  24.97 
 
 		 882 aa  174  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 886 aa  168  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 828 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 886 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 886 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 881 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 879 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 881 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 820 aa  162  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 886 aa  161  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 865 aa  160  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 906 aa  157  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 		 855 aa  157  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 		 866 aa  157  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0481  leucyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 		 999 aa  155  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.226346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 865 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  23.76 
 
 		 808 aa  152  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 925 aa  151  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 914 aa  147  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 881 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 834 aa  145  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 		 852 aa  144  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 		 879 aa  144  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 816 aa  144  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 879 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 829 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 835 aa  143  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 829 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 838 aa  141  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 880 aa  140  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 829 aa  140  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 874 aa  140  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 874 aa  140  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 863 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 		 881 aa  138  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.62 
 
 		 891 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 858 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 829 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0985  isoleucyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 927 aa  134  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 825 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 826 aa  134  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  21.37 
 
 		 802 aa  132  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 857 aa  132  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 1053 aa  131  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 883 aa  131  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2550  valyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 872 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 802 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1535  valyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 853 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 979 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 		 881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 		 883 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 884 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  21.7 
 
 		 880 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 824 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 		 911 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 802 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 804 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 824 aa  128  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 833 aa  128  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 805 aa  128  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 		 864 aa  128  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 968 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 955 aa  128  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 805 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  21.51 
 
 		 880 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 802 aa  127  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>