More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0367 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 944 aa  751    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 966 aa  784    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 955 aa  1977    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 924 aa  706    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 952 aa  666    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 962 aa  765    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 945 aa  728    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 955 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 939 aa  679    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 938 aa  746    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 925 aa  719    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 955 aa  679    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 969 aa  647    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 926 aa  712    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 950 aa  787    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 955 aa  681    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 946 aa  741    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 926 aa  689    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 945 aa  732    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 945 aa  721    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 932 aa  697    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 938 aa  633  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 983 aa  631  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 977 aa  610  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  35.6 
 
 		 934 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  29.47 
 
 		 1114 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  28.86 
 
 		 1094 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  28.23 
 
 		 1062 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  29.99 
 
 		 1093 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  30.17 
 
 		 1086 aa  328  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 		 831 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 881 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 879 aa  179  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 		 881 aa  177  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 		 882 aa  177  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 882 aa  177  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 809 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 881 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 886 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.92 
 
 		 886 aa  168  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 881 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 867 aa  167  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 886 aa  167  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 866 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 874 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 892 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 881 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 883 aa  164  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 865 aa  164  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 865 aa  164  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 881 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  164  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  164  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  164  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  164  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 		 856 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 876 aa  163  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  22.71 
 
 		 881 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 886 aa  163  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  23.56 
 
 		 881 aa  161  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 881 aa  160  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 856 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  23.1 
 
 		 891 aa  157  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  22.57 
 
 		 885 aa  156  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 906 aa  156  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 911 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 879 aa  153  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 880 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  23.11 
 
 		 861 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  22.54 
 
 		 864 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 883 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 		 909 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 1068 aa  151  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 876 aa  151  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 876 aa  151  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  23.3 
 
 		 880 aa  151  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 1002 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  23.43 
 
 		 883 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 909 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  22.76 
 
 		 1006 aa  149  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 		 895 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 918 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 		 918 aa  148  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  23.62 
 
 		 1068 aa  148  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 909 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 947 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.18 
 
 		 880 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 884 aa  145  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  23.02 
 
 		 854 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1070  valyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 1242 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147885  hitchhiker  0.000000182649 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 918 aa  145  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  22.42 
 
 		 856 aa  145  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 918 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 		 880 aa  144  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 891 aa  144  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 880 aa  144  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  21.74 
 
 		 881 aa  144  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>