More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2008 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 925 aa  1910    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 966 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 945 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  69.76 
 
 		 926 aa  1367    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 969 aa  667    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 952 aa  681    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 946 aa  662    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 924 aa  1275    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 945 aa  677    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 962 aa  774    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 955 aa  710    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 955 aa  719    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 950 aa  801    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 945 aa  670    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 939 aa  638    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 955 aa  704    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 938 aa  668    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 		 926 aa  1358    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 955 aa  709    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 932 aa  1210    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 944 aa  632  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 977 aa  634  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 983 aa  613  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 938 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.17 
 
 		 934 aa  523  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  30.47 
 
 		 1114 aa  382  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  29.54 
 
 		 1086 aa  364  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.95 
 
 		 1094 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  28.47 
 
 		 1062 aa  337  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  30.41 
 
 		 1093 aa  310  5.9999999999999995e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 889 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 		 824 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 829 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 		 882 aa  165  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 831 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 880 aa  159  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 861 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 1049 aa  157  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 855 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  23.1 
 
 		 977 aa  153  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  23.76 
 
 		 891 aa  151  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 882 aa  151  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 819 aa  150  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 882 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 883 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 882 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 881 aa  148  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  23.27 
 
 		 869 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 977 aa  147  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 891 aa  147  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 906 aa  145  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 906 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 977 aa  145  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 		 879 aa  144  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  21.64 
 
 		 886 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 883 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  22.46 
 
 		 904 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 930 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 881 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 881 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 888 aa  142  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 865 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 865 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  141  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  21.91 
 
 		 809 aa  141  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  141  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 881 aa  141  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  23.11 
 
 		 894 aa  140  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  21.44 
 
 		 886 aa  140  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  22.24 
 
 		 874 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 863 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  21.22 
 
 		 886 aa  140  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  22.76 
 
 		 872 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 980 aa  138  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 881 aa  139  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 		 881 aa  137  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 		 881 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  22 
 
 		 886 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 884 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 1033 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 864 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 		 858 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  22.56 
 
 		 991 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  21.96 
 
 		 881 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 880 aa  134  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 819 aa  135  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 866 aa  134  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  20.37 
 
 		 885 aa  134  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 		 882 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 877 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.39 
 
 		 880 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 896 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  21.9 
 
 		 905 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 903 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 883 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>