More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0366 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 860 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 860 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 810 aa  690    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 824 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 868 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 824 aa  694    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 878 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 860 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 860 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 820 aa  668    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 863 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4381  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 876 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 858 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 824 aa  702    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 859 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 868 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 864 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 824 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1022  leucyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 868 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 821 aa  658    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 823 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 823 aa  658    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 868 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 862 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 868 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 827 aa  683    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 862 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1202  leucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 875 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 864 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 837 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 862 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 872 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 874 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 819 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 827 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 868 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 851 aa  698    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 817 aa  704    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 830 aa  702    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 824 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 829 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 877 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 817 aa  698    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 815 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 868 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 865 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 826 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 862 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 829 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 819 aa  704    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 865 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 859 aa  657    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 834 aa  687    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 829 aa  707    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 825 aa  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 856 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 819 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 859 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 817 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0731  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 860 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0463588  normal  0.765619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 863 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 872 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 860 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 874 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 878 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 873 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 860 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 854 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 856 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 860 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0232  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 890 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 828 aa  693    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 944 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 817 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 861 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 871 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 863 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 821 aa  658    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 860 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 826 aa  741    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 859 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 859 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 864 aa  680    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 872 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 824 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 825 aa  688    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 859 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 873 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 824 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0990  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 858 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 829 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 859 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 859 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 859 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 906 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 823 aa  724    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 906 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 820 aa  669    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 864 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>