More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1924 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 938 aa  639    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 		 925 aa  1358    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 926 aa  1925    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 966 aa  755    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 932 aa  1180    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  71.49 
 
 		 926 aa  1408    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 955 aa  712    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 946 aa  640    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 955 aa  684    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 955 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 924 aa  1305    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 945 aa  649    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 962 aa  743    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 952 aa  653    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 955 aa  683    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 969 aa  644    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 950 aa  759    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 945 aa  650    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 945 aa  651    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 939 aa  630  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 		 944 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 983 aa  599  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 977 aa  594  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 		 938 aa  546  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  31.76 
 
 		 934 aa  511  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  29.72 
 
 		 1114 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  30.25 
 
 		 1086 aa  359  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  31.17 
 
 		 1094 aa  337  5e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  30.11 
 
 		 1093 aa  336  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  27.9 
 
 		 1062 aa  331  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  23.43 
 
 		 889 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 		 823 aa  160  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 		 882 aa  154  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 882 aa  154  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 834 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 		 880 aa  151  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 879 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 		 894 aa  147  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  23.52 
 
 		 891 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 876 aa  145  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 876 aa  145  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 		 886 aa  145  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 		 885 aa  143  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 		 886 aa  142  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 882 aa  142  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  23.34 
 
 		 861 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 880 aa  140  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.71 
 
 		 881 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.56 
 
 		 886 aa  138  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  22.08 
 
 		 880 aa  137  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 881 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 911 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 866 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  22.38 
 
 		 876 aa  136  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 		 872 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  21.39 
 
 		 802 aa  135  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 880 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 881 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 881 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 881 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 881 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 880 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 881 aa  134  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 882 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.02 
 
 		 881 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 881 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 865 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 883 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 977 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  22.57 
 
 		 880 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 904 aa  133  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  22.1 
 
 		 881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  21.95 
 
 		 881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 865 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2053  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 884 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  23.06 
 
 		 855 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 900 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 906 aa  132  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  22.02 
 
 		 881 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 		 977 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  21.95 
 
 		 869 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 879 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 930 aa  131  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  21.9 
 
 		 881 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 857 aa  130  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  21.35 
 
 		 881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  23.16 
 
 		 882 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 892 aa  129  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 874 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 909 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  21.77 
 
 		 881 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 856 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 1049 aa  127  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 977 aa  126  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 1058 aa  125  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 		 883 aa  125  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 848 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 872 aa  125  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 909 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>