More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0260 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 983 aa  642    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.72 
 
 		 934 aa  664    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 944 aa  832    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 955 aa  666    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 966 aa  664    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 926 aa  654    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 962 aa  643    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 939 aa  652    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 938 aa  745    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  81.06 
 
 		 945 aa  1626    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 955 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 955 aa  728    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 926 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 950 aa  705    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  79.03 
 
 		 946 aa  1576    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 952 aa  655    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 945 aa  1606    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 945 aa  1924    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 955 aa  668    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 938 aa  797    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 925 aa  675    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 969 aa  629  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 924 aa  628  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 977 aa  629  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 932 aa  618  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  31.49 
 
 		 1094 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  30.24 
 
 		 1062 aa  383  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  30.1 
 
 		 1093 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  28.85 
 
 		 1114 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  29.38 
 
 		 1086 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 829 aa  178  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 838 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.61 
 
 		 886 aa  150  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 886 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 		 867 aa  148  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 886 aa  148  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 823 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 824 aa  141  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 		 908 aa  141  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 		 908 aa  141  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 824 aa  141  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 882 aa  140  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 852 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.16 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.14 
 
 		 882 aa  139  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 874 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 826 aa  139  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 835 aa  137  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 		 905 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 857 aa  134  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 819 aa  134  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 825 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22 
 
 		 891 aa  134  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 865 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 861 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 863 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 831 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 827 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 824 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 829 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 829 aa  131  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 		 874 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 804 aa  130  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 		 903 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 837 aa  129  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 835 aa  129  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 833 aa  129  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 607 aa  129  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 819 aa  129  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 807 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 1031 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 906 aa  128  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09000  valyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 888 aa  128  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.521853  normal  0.529828 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 805 aa  128  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 931 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 884 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 		 954 aa  127  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 853 aa  126  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 858 aa  127  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 829 aa  127  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 826 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 802 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 859 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 830 aa  126  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 886 aa  126  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 883 aa  126  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1984  leucyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 841 aa  126  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000675596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 864 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 829 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 931 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 802 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 815 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 950 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>