More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0573 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 938 aa  1919    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 945 aa  745    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  50.48 
 
 		 934 aa  1004    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 944 aa  794    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 946 aa  743    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 938 aa  804    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 945 aa  745    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 945 aa  739    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 955 aa  633  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 950 aa  629  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 955 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 955 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 955 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 952 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 983 aa  567  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 966 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 926 aa  558  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 925 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 962 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 969 aa  551  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 		 926 aa  546  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 939 aa  539  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 977 aa  533  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 924 aa  525  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 932 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  26.02 
 
 		 1093 aa  350  6e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  27.99 
 
 		 1094 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  26.55 
 
 		 1114 aa  327  6e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  25.98 
 
 		 1086 aa  307  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  25.62 
 
 		 1062 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 882 aa  163  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  23.22 
 
 		 883 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 886 aa  161  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 886 aa  160  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 865 aa  159  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 886 aa  159  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.92 
 
 		 865 aa  158  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 886 aa  157  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 		 880 aa  156  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 881 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 874 aa  155  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 918 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 		 879 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 882 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 883 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  20.09 
 
 		 891 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  23.14 
 
 		 879 aa  147  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  21.59 
 
 		 904 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.31 
 
 		 880 aa  144  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  21.38 
 
 		 907 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 909 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  22.05 
 
 		 880 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 885 aa  140  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 874 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  22.49 
 
 		 866 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  21.64 
 
 		 881 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 918 aa  140  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 925 aa  139  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 880 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  22.54 
 
 		 884 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 		 880 aa  138  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 867 aa  137  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 918 aa  137  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  21.67 
 
 		 883 aa  137  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 		 911 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  21.76 
 
 		 880 aa  137  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  21.5 
 
 		 906 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  22.98 
 
 		 816 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  22.35 
 
 		 881 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 		 858 aa  134  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 820 aa  134  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 		 881 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  21.89 
 
 		 892 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 881 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 805 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 805 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  22.32 
 
 		 914 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 879 aa  132  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2178  valyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 		 976 aa  132  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 868 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  22.35 
 
 		 891 aa  132  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  22.24 
 
 		 881 aa  132  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 863 aa  132  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 		 881 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  22.05 
 
 		 881 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  22.38 
 
 		 950 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  21.58 
 
 		 896 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 881 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 880 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 881 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 881 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 1006 aa  131  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 830 aa  131  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  21.58 
 
 		 880 aa  131  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 883 aa  130  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 859 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 607 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  22 
 
 		 904 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>