More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0691 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.03 
 
 		 934 aa  669    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 944 aa  837    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 925 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 955 aa  676    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 966 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 938 aa  743    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 955 aa  685    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 938 aa  801    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 952 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 924 aa  636    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 962 aa  658    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  80.51 
 
 		 945 aa  1607    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 983 aa  650    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 946 aa  1921    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 955 aa  681    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 926 aa  640    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 950 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 955 aa  741    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 926 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  79.03 
 
 		 945 aa  1591    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  79.03 
 
 		 945 aa  1576    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 939 aa  664    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 977 aa  630  1e-179  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 969 aa  616  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 932 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  28.8 
 
 		 1114 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  29.5 
 
 		 1094 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  30.24 
 
 		 1062 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  27.82 
 
 		 1086 aa  360  7e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  28.17 
 
 		 1093 aa  332  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 856 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 805 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 823 aa  156  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 813 aa  154  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 824 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 824 aa  149  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 825 aa  148  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 829 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 		 882 aa  146  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 909 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 835 aa  143  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 857 aa  142  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 864 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 819 aa  142  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 863 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 808 aa  141  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 838 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 828 aa  140  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 859 aa  140  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 859 aa  140  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 831 aa  139  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 859 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 829 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 824 aa  139  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 817 aa  140  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 906 aa  139  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 859 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 859 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 874 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 859 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0990  leucyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 858 aa  138  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 874 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 874 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 906 aa  138  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 859 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 824 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 826 aa  137  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 827 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  24.72 
 
 		 805 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 837 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 826 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 865 aa  137  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 810 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 881 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 886 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 859 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 816 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 815 aa  135  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 824 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 868 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 872 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 802 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 829 aa  134  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 886 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 871 aa  134  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 830 aa  134  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 807 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 802 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 857 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 886 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 872 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 829 aa  134  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 829 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 		 805 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1984  leucyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 841 aa  133  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000675596 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 804 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 863 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>