More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0665 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 860 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 860 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 819 aa  828    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 813 aa  687    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 824 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 814 aa  715    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 858 aa  870    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 804 aa  929    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 806 aa  879    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 865 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 802 aa  944    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 828 aa  678    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 860 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 833 aa  887    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 860 aa  643    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 860 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 802 aa  941    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 802 aa  941    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 801 aa  787    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 802 aa  941    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 805 aa  885    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 816 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 824 aa  729    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 807 aa  741    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 835 aa  820    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 860 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 860 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 952 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  80.99 
 
 		 805 aa  1389    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 813 aa  682    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 872 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 805 aa  885    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 819 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 820 aa  641    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 851 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 949 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  79.25 
 
 		 805 aa  1341    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 904 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  82.61 
 
 		 805 aa  1421    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 863 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 824 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 829 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 819 aa  711    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 802 aa  941    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 865 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 826 aa  684    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 804 aa  796    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 815 aa  675    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 829 aa  726    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 1016 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 858 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 817 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 838 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 969 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 819 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 857 aa  876    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 823 aa  704    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 860 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 860 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 802 aa  951    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 971 aa  707    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 861 aa  642    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 820 aa  639    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 819 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 824 aa  721    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 971 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 817 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 870 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 824 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 825 aa  718    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 816 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 816 aa  669    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 860 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 859 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 825 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 857 aa  872    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 863 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 824 aa  712    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 827 aa  698    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  48.9 
 
 		 879 aa  815    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 860 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 829 aa  856    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 829 aa  871    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 804 aa  884    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 808 aa  916    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 833 aa  883    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 843 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 904 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 802 aa  935    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 954 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 987 aa  652    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 859 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 823 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  78.3 
 
 		 816 aa  1329    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 860 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 864 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 971 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 826 aa  668    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 968 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 864 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>