More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1654 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
857 aa  844    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
826 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
819 aa  772    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
813 aa  693    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
824 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
819 aa  683    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
802 aa  915    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
858 aa  862    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
804 aa  899    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
840 aa  796    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
804 aa  724    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
802 aa  919    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
802 aa  915    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
833 aa  864    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
802 aa  919    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
826 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
904 aa  680    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
802 aa  915    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 
802 aa  916    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
801 aa  689    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
802 aa  915    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
1016 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
806 aa  889    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
969 aa  764    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
805 aa  865    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
830 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
987 aa  750    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
825 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
805 aa  865    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
872 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
971 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
968 aa  785    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
830 aa  714    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
851 aa  661    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
805 aa  858    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
802 aa  917    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
805 aa  879    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
837 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
824 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
829 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
805 aa  865    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
802 aa  915    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
954 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
865 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
824 aa  709    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
804 aa  714    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
904 aa  693    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
829 aa  716    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
856 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
858 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
1064 aa  769    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
824 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
802 aa  922    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
810 aa  695    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
828 aa  671    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
807 aa  707    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
832 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
857 aa  1776    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
814 aa  673    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
824 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
856 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
819 aa  653    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
971 aa  804    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
817 aa  697    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2911  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
832 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.084861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
823 aa  704    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  51.29 
 
 
899 aa  848    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
816 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
816 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
806 aa  859    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  45.11 
 
 
879 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
825 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
824 aa  719    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
952 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
854 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
824 aa  721    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
816 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
813 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
829 aa  829    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
829 aa  886    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
804 aa  862    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
808 aa  883    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 
833 aa  884    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
817 aa  691    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
806 aa  865    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
814 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
807 aa  876    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
858 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
823 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
816 aa  830    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
835 aa  830    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
806 aa  739    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
971 aa  804    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
802 aa  914    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
968 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
834 aa  650    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
829 aa  700    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
827 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
949 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
827 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>