More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3225 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 923 aa  738    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 857 aa  818    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 819 aa  698    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 968 aa  1263    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 925 aa  743    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 858 aa  781    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 804 aa  787    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 		 984 aa  1197    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 802 aa  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 936 aa  773    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 833 aa  775    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 987 aa  1132    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 802 aa  800    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 802 aa  800    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 936 aa  846    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 802 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 		 949 aa  1192    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 951 aa  1199    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 802 aa  795    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 969 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 971 aa  1228    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 806 aa  744    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 954 aa  1940    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 		 978 aa  1248    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 824 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 807 aa  714    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 802 aa  803    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 805 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 963 aa  1193    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 805 aa  726    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 840 aa  778    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 958 aa  1188    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 857 aa  694    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 802 aa  800    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 805 aa  743    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 1016 aa  1081    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 952 aa  1208    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 922 aa  737    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 1064 aa  1099    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 854 aa  800    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 838 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 802 aa  805    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 805 aa  715    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  93.07 
 
 		 952 aa  1774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 978 aa  1182    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 805 aa  743    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 954 aa  727    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 990 aa  1156    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 802 aa  800    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 944 aa  740    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 971 aa  1226    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 801 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  69.72 
 
 		 950 aa  1366    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  42.56 
 
 		 899 aa  699    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 921 aa  740    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 906 aa  882    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  57.48 
 
 		 994 aa  1118    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 806 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  46.78 
 
 		 879 aa  669    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 949 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 805 aa  808    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 969 aa  1189    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 829 aa  761    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 829 aa  725    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 804 aa  726    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 808 aa  763    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 833 aa  776    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 982 aa  1199    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 835 aa  744    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  67.37 
 
 		 949 aa  1303    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 802 aa  801    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  65.97 
 
 		 934 aa  1268    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 816 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 984 aa  1223    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 971 aa  1226    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 805 aa  808    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 968 aa  1213    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 806 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 985 aa  1168    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 802 aa  808    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 804 aa  632  1e-179  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 806 aa  630  1e-179  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 816 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 829 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 824 aa  625  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 807 aa  625  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 800 aa  622  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 875 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 826 aa  614  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 810 aa  615  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 823 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 856 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 875 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 813 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 817 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 824 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 856 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 819 aa  608  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 825 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>