More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl490 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
824 aa  656    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
819 aa  689    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
828 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
858 aa  793    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
804 aa  935    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  903    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  906    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
816 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
833 aa  879    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
807 aa  764    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
805 aa  903    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  905    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
802 aa  907    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
801 aa  1648    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  905    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
805 aa  781    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
857 aa  699    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  906    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
816 aa  648    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
802 aa  903    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
825 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
830 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
906 aa  672    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
805 aa  766    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
805 aa  776    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
810 aa  681    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
824 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
801 aa  717    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
840 aa  736    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  905    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 
805 aa  910    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 
807 aa  797    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
865 aa  636    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 
805 aa  910    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  70.77 
 
 
804 aa  1217    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
854 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
829 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
858 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
857 aa  707    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  45 
 
 
814 aa  661    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
802 aa  905    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
806 aa  785    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
838 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
800 aa  684    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
817 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
806 aa  811    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
816 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
835 aa  738    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
802 aa  902    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  47.8 
 
 
899 aa  758    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
806 aa  866    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
824 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
829 aa  855    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
829 aa  815    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
804 aa  845    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
808 aa  855    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
833 aa  883    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
804 aa  887    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
806 aa  902    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
936 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
816 aa  757    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
838 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
802 aa  905    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
817 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  46.11 
 
 
879 aa  721    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
805 aa  909    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
872 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
824 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
832 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2911  leucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
832 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.084861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
826 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
816 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
824 aa  626  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
950 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
875 aa  624  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
858 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
824 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
827 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
856 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
824 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
958 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
856 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
827 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
835 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
824 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
824 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
826 aa  615  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
819 aa  612  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
859 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
971 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
819 aa  613  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
971 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
971 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
968 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
814 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
823 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
828 aa  608  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
820 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
825 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1582  leucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
838 aa  612  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>