More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1485 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  100 
 
 		 934 aa  1897    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 944 aa  732    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 938 aa  754    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 945 aa  664    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 945 aa  667    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 946 aa  669    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 938 aa  1004    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 945 aa  670    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 955 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 950 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 983 aa  532  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 926 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 925 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 926 aa  511  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 932 aa  504  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 966 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 962 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 939 aa  493  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 955 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 924 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 955 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 955 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 952 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 977 aa  463  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 969 aa  432  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  26.52 
 
 		 1094 aa  298  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  25.48 
 
 		 1114 aa  295  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  25.64 
 
 		 1093 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  25.72 
 
 		 1062 aa  272  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  23.42 
 
 		 1086 aa  197  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 823 aa  177  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 867 aa  172  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  24.25 
 
 		 819 aa  170  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 874 aa  168  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 882 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 865 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 865 aa  164  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 		 886 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 		 879 aa  160  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 886 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 858 aa  158  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 879 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 874 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 866 aa  153  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 886 aa  154  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  22.1 
 
 		 882 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 817 aa  152  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  21.95 
 
 		 879 aa  152  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 883 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  21.72 
 
 		 891 aa  149  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 880 aa  149  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 884 aa  147  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2572  valyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 		 884 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00293466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  21.9 
 
 		 881 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 		 885 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 829 aa  145  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  23.54 
 
 		 809 aa  144  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1237  valyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 870 aa  144  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  20.99 
 
 		 883 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  23.75 
 
 		 810 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 892 aa  141  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0866  valyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 		 870 aa  141  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 		 932 aa  141  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 		 909 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  23.39 
 
 		 820 aa  139  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 		 883 aa  138  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0796  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 870 aa  138  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.933031  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  23.23 
 
 		 820 aa  137  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 933 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1227  valyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 		 874 aa  136  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 933 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  21.22 
 
 		 954 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 879 aa  135  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 		 880 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  21.59 
 
 		 881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  21.66 
 
 		 904 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  20.54 
 
 		 887 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  21.15 
 
 		 884 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  22.56 
 
 		 880 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  22.05 
 
 		 909 aa  130  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 		 880 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 		 883 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 880 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 829 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 931 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 		 929 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 		 883 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  21.02 
 
 		 876 aa  128  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0966  valyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 873 aa  128  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 833 aa  128  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  20.16 
 
 		 886 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  20.68 
 
 		 880 aa  127  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 876 aa  127  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 876 aa  127  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  21.16 
 
 		 828 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 		 924 aa  125  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1252  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 918 aa  125  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  20.48 
 
 		 883 aa  125  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1889  isoleucyl-tRNA synthetase  20.92 
 
 		 923 aa  125  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 833 aa  125  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>