More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2923 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 925 aa  1275    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 952 aa  659    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 966 aa  759    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 969 aa  642    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 955 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 924 aa  1921    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  67.54 
 
 		 926 aa  1335    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 962 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 926 aa  1305    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 950 aa  818    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 955 aa  671    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 946 aa  636    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 955 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 955 aa  706    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  59.98 
 
 		 932 aa  1162    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 945 aa  632  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 945 aa  631  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 938 aa  627  1e-178  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 945 aa  628  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 944 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 939 aa  600  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 977 aa  597  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 983 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 938 aa  525  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.48 
 
 		 934 aa  484  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  30.03 
 
 		 1086 aa  357  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  33.15 
 
 		 1094 aa  349  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  28.27 
 
 		 1114 aa  342  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  28.71 
 
 		 1062 aa  340  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  27.58 
 
 		 1093 aa  337  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 880 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 882 aa  160  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 819 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 894 aa  154  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 880 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 891 aa  153  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 		 880 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 		 882 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 		 977 aa  151  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 		 881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 883 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 824 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  22.2 
 
 		 879 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 		 891 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  23.3 
 
 		 879 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 879 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  21.83 
 
 		 881 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  22.49 
 
 		 881 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  22.86 
 
 		 977 aa  145  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 861 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 1033 aa  145  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 866 aa  144  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  22.45 
 
 		 881 aa  144  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 1068 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 		 865 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 882 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 977 aa  144  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 865 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 		 876 aa  143  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 		 876 aa  143  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 867 aa  143  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 882 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 881 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 		 863 aa  142  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 892 aa  142  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 		 885 aa  142  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 881 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 		 872 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.72 
 
 		 880 aa  141  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 886 aa  141  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 		 876 aa  141  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 882 aa  141  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  23.34 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 881 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 886 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  21.45 
 
 		 880 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  22.2 
 
 		 904 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 880 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 		 855 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  22.54 
 
 		 908 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  22.54 
 
 		 908 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 884 aa  139  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 		 1049 aa  138  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 881 aa  138  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 879 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 		 902 aa  137  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 886 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  23.54 
 
 		 980 aa  137  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 856 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 		 869 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 880 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 929 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  22.21 
 
 		 880 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  22.11 
 
 		 886 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  23.61 
 
 		 881 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>