More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0233 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 
955 aa  1291    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
939 aa  652    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
926 aa  672    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
966 aa  908    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
926 aa  652    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
955 aa  660    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
969 aa  1991    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
924 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
962 aa  870    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 
955 aa  1284    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  64.81 
 
 
955 aa  1292    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 
952 aa  1254    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
950 aa  832    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
925 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
932 aa  657    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
945 aa  634  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
945 aa  628  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
945 aa  628  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
946 aa  624  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
944 aa  598  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
938 aa  598  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
977 aa  595  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
983 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
938 aa  559  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  29.54 
 
 
934 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  28.32 
 
 
1094 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  27.99 
 
 
1114 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.6 
 
 
1062 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  28.79 
 
 
1086 aa  333  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  30.63 
 
 
1093 aa  312  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  21.96 
 
 
882 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 
881 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  21.9 
 
 
874 aa  159  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  21.33 
 
 
879 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
879 aa  156  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 
883 aa  155  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  21.09 
 
 
880 aa  155  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 
886 aa  155  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.54 
 
 
886 aa  154  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  21.89 
 
 
881 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 
886 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  22.07 
 
 
884 aa  148  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  22.62 
 
 
883 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  20.05 
 
 
881 aa  147  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  20.58 
 
 
882 aa  147  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 
991 aa  147  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 
886 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  21.73 
 
 
911 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
825 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 
906 aa  145  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  20.59 
 
 
886 aa  145  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
823 aa  144  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  21.69 
 
 
866 aa  144  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 
892 aa  144  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 
867 aa  143  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  21.32 
 
 
865 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  21.01 
 
 
891 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  21.46 
 
 
909 aa  143  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  21.32 
 
 
865 aa  142  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 
879 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2450  valyl-tRNA synthetase  21 
 
 
887 aa  141  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970931  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  21.56 
 
 
809 aa  141  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  20.72 
 
 
894 aa  140  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 
864 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  21.08 
 
 
880 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  20.88 
 
 
880 aa  138  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  20.41 
 
 
883 aa  138  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
819 aa  137  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  20.16 
 
 
887 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  20.16 
 
 
883 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  20.85 
 
 
874 aa  135  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
829 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
829 aa  135  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  19.98 
 
 
885 aa  135  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  20.77 
 
 
902 aa  133  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  22.45 
 
 
909 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 
824 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 
824 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  21.41 
 
 
920 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  21.58 
 
 
909 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
826 aa  133  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
829 aa  132  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
865 aa  132  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  22.64 
 
 
909 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 
1002 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
829 aa  131  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  21.41 
 
 
919 aa  131  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  20.73 
 
 
947 aa  131  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  21.18 
 
 
884 aa  131  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 
815 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2855  valyl-tRNA synthetase  20.78 
 
 
921 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  19.55 
 
 
876 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  24.83 
 
 
829 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  20.84 
 
 
881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  25 
 
 
830 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 
802 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
874 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
802 aa  129  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 
896 aa  129  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
874 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>