More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1469 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
955 aa  697    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
945 aa  640    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
939 aa  1921    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
955 aa  679    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
966 aa  716    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
955 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
983 aa  793    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
962 aa  706    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
945 aa  652    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
925 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
969 aa  639    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
946 aa  664    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
950 aa  714    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
945 aa  644    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
952 aa  691    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
926 aa  637    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
955 aa  701    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
926 aa  630  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
944 aa  626  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
932 aa  628  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
938 aa  624  1e-177  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
924 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
977 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
938 aa  539  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.23 
 
 
934 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  28.68 
 
 
1114 aa  378  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  27.66 
 
 
1062 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  29.05 
 
 
1086 aa  354  5e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  27.5 
 
 
1093 aa  353  5.9999999999999994e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  29.66 
 
 
1094 aa  307  7e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 
824 aa  194  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 
824 aa  191  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  24.97 
 
 
823 aa  184  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 
819 aa  174  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 
933 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 
828 aa  170  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 
881 aa  157  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 
933 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  22.56 
 
 
947 aa  156  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
918 aa  156  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 
933 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 
911 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 
882 aa  150  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 
867 aa  149  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  21.63 
 
 
925 aa  148  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  22.72 
 
 
817 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 
914 aa  145  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 
883 aa  145  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 
918 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 
874 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 
918 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 
879 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
825 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  21.73 
 
 
879 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 
929 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 
881 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2450  valyl-tRNA synthetase  22.02 
 
 
887 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2572  valyl-tRNA synthetase  22.81 
 
 
884 aa  135  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00293466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 
891 aa  135  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 
879 aa  134  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 
909 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
826 aa  134  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
865 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  23.23 
 
 
881 aa  132  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
817 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 
948 aa  131  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
824 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
830 aa  129  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0966  valyl-tRNA synthetase  22.39 
 
 
873 aa  128  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 
805 aa  127  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
805 aa  127  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1076  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 
873 aa  127  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
829 aa  127  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0645  valyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 
870 aa  126  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  22.08 
 
 
904 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1334  valyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
977 aa  126  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
805 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
833 aa  125  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
804 aa  125  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  21.07 
 
 
864 aa  125  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
885 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
824 aa  124  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  21.94 
 
 
876 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
802 aa  124  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  21.94 
 
 
876 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 
831 aa  124  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
805 aa  124  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  20.49 
 
 
876 aa  124  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
851 aa  124  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 
859 aa  124  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
804 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 
833 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 
881 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
810 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 
800 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>