More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2048 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 952 aa  855    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 944 aa  649    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 938 aa  687    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 946 aa  667    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 939 aa  716    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 969 aa  898    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 926 aa  748    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 966 aa  1999    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 925 aa  783    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 955 aa  784    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 945 aa  653    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 926 aa  755    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 924 aa  759    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 945 aa  664    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 962 aa  1418    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 983 aa  678    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 955 aa  868    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 955 aa  870    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 950 aa  1231    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 955 aa  870    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 932 aa  746    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 977 aa  679    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 945 aa  652    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 938 aa  563  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  31.02 
 
 		 934 aa  503  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.12 
 
 		 1094 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  28.15 
 
 		 1086 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  30.94 
 
 		 1114 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.28 
 
 		 1062 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  28.97 
 
 		 1093 aa  343  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 881 aa  194  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 879 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 886 aa  188  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  23.76 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 882 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  23.52 
 
 		 865 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 		 886 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  23.52 
 
 		 865 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 		 869 aa  178  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  25.05 
 
 		 911 aa  177  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  23.11 
 
 		 891 aa  177  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 		 879 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 879 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  23.23 
 
 		 855 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 867 aa  172  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 		 865 aa  171  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 		 882 aa  171  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 883 aa  171  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.54 
 
 		 881 aa  170  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 880 aa  170  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  23.34 
 
 		 885 aa  170  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 918 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 906 aa  169  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.02 
 
 		 881 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 897 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 874 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 828 aa  164  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 863 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 		 1049 aa  164  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 909 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 886 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 		 909 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  22.27 
 
 		 865 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 909 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  22.98 
 
 		 884 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 884 aa  160  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  22.98 
 
 		 892 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 977 aa  159  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2073  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 888 aa  159  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 933 aa  158  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 933 aa  158  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 		 874 aa  158  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 918 aa  158  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 918 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 918 aa  157  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 		 1006 aa  155  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 980 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 885 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  21.26 
 
 		 883 aa  154  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 		 908 aa  154  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 		 884 aa  154  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 925 aa  153  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  22.86 
 
 		 929 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  21.97 
 
 		 880 aa  153  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1070  valyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 		 1242 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147885  hitchhiker  0.000000182649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 933 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 		 881 aa  152  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 1059 aa  151  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 888 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 865 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1477  valyl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 1052 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516539  normal  0.491266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  21.55 
 
 		 881 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  21.95 
 
 		 888 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 876 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 800 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 876 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 883 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 		 929 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 861 aa  148  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 879 aa  148  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>