More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0690 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 944 aa  652    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 926 aa  1920    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 945 aa  669    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 939 aa  637    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 955 aa  708    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 952 aa  692    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 966 aa  748    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 946 aa  640    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 945 aa  654    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  69.76 
 
 		 925 aa  1367    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  71.49 
 
 		 926 aa  1408    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  67.54 
 
 		 924 aa  1335    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 962 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 955 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 955 aa  703    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 938 aa  682    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 950 aa  802    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 955 aa  689    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 977 aa  642    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 945 aa  664    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 969 aa  662    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 932 aa  1197    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 983 aa  612  1e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 938 aa  558  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  31.54 
 
 		 934 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  29.28 
 
 		 1094 aa  369  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.53 
 
 		 1062 aa  354  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  32.11 
 
 		 1114 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  31.36 
 
 		 1086 aa  322  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  32.34 
 
 		 1093 aa  310  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 880 aa  160  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  23.52 
 
 		 863 aa  155  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 894 aa  155  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 882 aa  151  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  22.15 
 
 		 882 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  23.06 
 
 		 876 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  23.06 
 
 		 876 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 891 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 879 aa  145  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.22 
 
 		 882 aa  145  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 891 aa  144  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 		 860 aa  144  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 977 aa  144  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 881 aa  142  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.11 
 
 		 881 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 930 aa  142  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 881 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 881 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 977 aa  141  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 881 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 		 883 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 879 aa  139  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 855 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 880 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  22.38 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  22.71 
 
 		 881 aa  139  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 977 aa  138  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 881 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 876 aa  137  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 1068 aa  137  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 		 860 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 879 aa  135  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 1036 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 906 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 		 882 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.15 
 
 		 879 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  21.66 
 
 		 808 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  23.11 
 
 		 1050 aa  131  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 881 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 880 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 874 aa  130  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1187  leucyl-tRNA synthetase  23.39 
 
 		 860 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0879565  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 904 aa  130  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 879 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  22.42 
 
 		 874 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 		 861 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  22.05 
 
 		 806 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.42 
 
 		 880 aa  128  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 		 980 aa  128  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  21.6 
 
 		 802 aa  127  7e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1535  valyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 853 aa  127  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 885 aa  127  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  21.72 
 
 		 881 aa  127  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.38 
 
 		 865 aa  127  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.38 
 
 		 865 aa  126  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 		 869 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  21.31 
 
 		 904 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  21.23 
 
 		 907 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 858 aa  126  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  22.2 
 
 		 1049 aa  125  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  22.34 
 
 		 881 aa  125  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 880 aa  125  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 872 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 883 aa  124  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>