More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0187 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 944 aa  640    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 939 aa  697    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 966 aa  868    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 945 aa  668    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 926 aa  684    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  64.81 
 
 		 969 aa  1277    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 925 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 924 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 945 aa  674    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 962 aa  860    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  84.3 
 
 		 952 aa  1672    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  97.17 
 
 		 955 aa  1915    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  97.59 
 
 		 955 aa  1917    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 950 aa  863    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 926 aa  708    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 977 aa  661    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 946 aa  685    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 945 aa  670    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 955 aa  1956    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 932 aa  687    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 955 aa  677    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 938 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 983 aa  625  1e-177  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 938 aa  587  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.06 
 
 		 934 aa  484  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  29.79 
 
 		 1114 aa  398  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  30.2 
 
 		 1093 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  30.5 
 
 		 1086 aa  391  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  27.03 
 
 		 1094 aa  376  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  30.6 
 
 		 1062 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 882 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 882 aa  178  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.62 
 
 		 881 aa  172  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.1 
 
 		 874 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 883 aa  171  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 911 aa  171  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 881 aa  170  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 		 879 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 881 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 883 aa  165  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 885 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  23.16 
 
 		 883 aa  161  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 909 aa  157  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.86 
 
 		 865 aa  157  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 		 879 aa  157  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 865 aa  156  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 		 880 aa  156  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 886 aa  154  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  21.51 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 824 aa  151  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 		 866 aa  150  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  21.75 
 
 		 891 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 879 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  23.65 
 
 		 1002 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  21.08 
 
 		 881 aa  149  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  21.15 
 
 		 883 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 906 aa  147  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  21.16 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  21.46 
 
 		 884 aa  147  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 894 aa  147  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 919 aa  147  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 886 aa  147  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 886 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 881 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 886 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  21.91 
 
 		 922 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  22.27 
 
 		 880 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 933 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 892 aa  145  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  22.37 
 
 		 881 aa  145  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 933 aa  145  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 930 aa  145  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  22.46 
 
 		 880 aa  145  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  22.05 
 
 		 947 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 991 aa  144  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.2 
 
 		 881 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  22.37 
 
 		 881 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 		 909 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 881 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  23.54 
 
 		 1006 aa  144  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 881 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 881 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 881 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  22.37 
 
 		 881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  22.37 
 
 		 928 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  21.87 
 
 		 883 aa  142  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  22.2 
 
 		 909 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 881 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  22.31 
 
 		 892 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  21.97 
 
 		 881 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  22.04 
 
 		 933 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 920 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  21.91 
 
 		 902 aa  140  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 886 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42662  predicted protein  21.7 
 
 		 924 aa  140  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  21.67 
 
 		 880 aa  139  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  21.81 
 
 		 880 aa  138  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  20.87 
 
 		 865 aa  138  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  21.13 
 
 		 880 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  20.97 
 
 		 876 aa  138  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>