More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1654 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  40.78 
 
 		 934 aa  732    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 944 aa  1932    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 938 aa  794    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 955 aa  751    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 946 aa  837    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 966 aa  649    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 938 aa  1196    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 983 aa  641    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 926 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 945 aa  819    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 945 aa  832    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 955 aa  640    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 950 aa  640    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 945 aa  832    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 955 aa  641    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 955 aa  637    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 925 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 962 aa  629  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 939 aa  626  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 977 aa  625  1e-177  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 		 926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 924 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 952 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 932 aa  601  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 969 aa  586  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  29.8 
 
 		 1114 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.2 
 
 		 1062 aa  350  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  29.27 
 
 		 1093 aa  346  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.98 
 
 		 1094 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  28.06 
 
 		 1086 aa  341  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 809 aa  187  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 882 aa  181  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  23.65 
 
 		 865 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 		 867 aa  174  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 886 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 886 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 886 aa  173  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 882 aa  173  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 863 aa  172  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 886 aa  172  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 879 aa  171  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 858 aa  168  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 879 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.76 
 
 		 874 aa  165  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 881 aa  164  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 808 aa  163  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 881 aa  163  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 802 aa  162  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  23.27 
 
 		 866 aa  160  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 881 aa  160  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 		 906 aa  160  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  22.34 
 
 		 880 aa  158  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 881 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 		 865 aa  156  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 879 aa  156  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  22.17 
 
 		 865 aa  156  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1076  valyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 873 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 880 aa  154  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 892 aa  154  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 863 aa  154  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 933 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 933 aa  154  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 909 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 876 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 876 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 880 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 		 909 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 883 aa  151  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  22 
 
 		 883 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 		 881 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 883 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  21.82 
 
 		 891 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 920 aa  149  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 		 918 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  22.2 
 
 		 880 aa  148  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 919 aa  148  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  21.05 
 
 		 884 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 880 aa  147  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.11 
 
 		 911 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 		 908 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 874 aa  146  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1227  valyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 874 aa  145  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  23.04 
 
 		 896 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1094  isoleucyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 928 aa  145  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 918 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  23.75 
 
 		 918 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 		 876 aa  144  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0966  valyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 873 aa  144  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 932 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>