More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1940 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  41.03 
 
 		 934 aa  754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 944 aa  1196    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 926 aa  639    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 926 aa  682    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 983 aa  662    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 966 aa  687    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 945 aa  805    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 950 aa  664    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 938 aa  1939    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 955 aa  746    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 977 aa  636    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 945 aa  815    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 945 aa  797    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 932 aa  639    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 925 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 938 aa  804    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 946 aa  801    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 955 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 955 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 924 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 939 aa  624  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 955 aa  623  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 962 aa  622  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 952 aa  611  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 969 aa  587  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  30.36 
 
 		 1114 aa  396  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  32.92 
 
 		 1094 aa  352  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.18 
 
 		 1062 aa  350  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  28.04 
 
 		 1093 aa  330  8e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  27.62 
 
 		 1086 aa  320  6e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  22.52 
 
 		 855 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 865 aa  172  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 879 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 882 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 886 aa  166  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 		 886 aa  165  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 886 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  22.92 
 
 		 886 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 881 aa  163  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 918 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 896 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 906 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 881 aa  154  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 867 aa  152  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 		 809 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 		 864 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 		 909 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  23.14 
 
 		 865 aa  148  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 863 aa  147  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  23.92 
 
 		 909 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  22.09 
 
 		 863 aa  146  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.81 
 
 		 865 aa  145  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 865 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 		 864 aa  145  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 883 aa  144  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 802 aa  143  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 907 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  22.11 
 
 		 866 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 909 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 891 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  22.87 
 
 		 904 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 954 aa  141  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 808 aa  140  7.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 805 aa  140  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 805 aa  140  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 904 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.27 
 
 		 874 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 858 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 930 aa  137  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 800 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  22.34 
 
 		 883 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 805 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 824 aa  135  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 		 881 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  21.54 
 
 		 874 aa  135  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2450  valyl-tRNA synthetase  22.21 
 
 		 887 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 947 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 908 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 824 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 823 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1889  isoleucyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 923 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  21.16 
 
 		 927 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 		 1152 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 		 968 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  23.12 
 
 		 880 aa  131  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 817 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2550  valyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 872 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  21.44 
 
 		 920 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  23.52 
 
 		 947 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1089  isoleucyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 		 927 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000209628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 829 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  22.21 
 
 		 979 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 880 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 883 aa  129  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 879 aa  129  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 805 aa  129  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 819 aa  129  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 804 aa  127  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>