More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77997 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  54.72 
 
 		 1062 aa  1174    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  37.71 
 
 		 1086 aa  726    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  47.09 
 
 		 1114 aa  1056    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  44.48 
 
 		 1094 aa  891    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  100 
 
 		 1093 aa  2271    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 977 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 950 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 952 aa  392  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 955 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 955 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 955 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 945 aa  379  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 945 aa  375  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 938 aa  373  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 945 aa  372  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 955 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 962 aa  369  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 969 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 966 aa  363  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 939 aa  354  5e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 		 938 aa  350  6e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 944 aa  349  2e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 946 aa  348  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 983 aa  347  8.999999999999999e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 926 aa  345  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 925 aa  344  5e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 926 aa  341  5.9999999999999996e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 924 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 932 aa  336  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  25.85 
 
 		 934 aa  280  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  21.24 
 
 		 886 aa  85.9  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  21.07 
 
 		 886 aa  85.1  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  21.4 
 
 		 886 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  20.94 
 
 		 886 aa  83.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  21.4 
 
 		 906 aa  82  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 		 882 aa  76.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  20.67 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 869 aa  72.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 825 aa  72.4  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 882 aa  72  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 809 aa  72  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  20.68 
 
 		 880 aa  71.6  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3216  isoleucyl-tRNA synthetase  19.98 
 
 		 937 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 675 aa  70.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 904 aa  68.9  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  19.94 
 
 		 954 aa  68.9  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  21.59 
 
 		 977 aa  68.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  20.59 
 
 		 931 aa  67.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  21.21 
 
 		 874 aa  67.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1252  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  20.3 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  19.85 
 
 		 866 aa  64.3  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  20.25 
 
 		 931 aa  64.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 813 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 906 aa  63.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  19.4 
 
 		 947 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  20.92 
 
 		 957 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 806 aa  63.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  20.73 
 
 		 972 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  22.54 
 
 		 865 aa  63.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  21.76 
 
 		 980 aa  63.2  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  20.04 
 
 		 879 aa  63.2  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 856 aa  62.4  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  20.95 
 
 		 968 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 824 aa  62  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 856 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 863 aa  62  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  20.28 
 
 		 948 aa  62  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  21.72 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 856 aa  61.6  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 864 aa  61.6  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  21.24 
 
 		 977 aa  61.2  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 810 aa  60.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  19.85 
 
 		 881 aa  60.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4095  valyl-tRNA synthetase  19.88 
 
 		 880 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 824 aa  60.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 824 aa  60.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 824 aa  60.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  21.48 
 
 		 894 aa  61.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 813 aa  60.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 		 813 aa  60.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 857 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 829 aa  60.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  20.8 
 
 		 914 aa  60.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  22.92 
 
 		 858 aa  60.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 857 aa  60.1  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 929 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 		 859 aa  60.1  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1118  isoleucyl-tRNA synthetase  20.9 
 
 		 938 aa  59.7  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00413581  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 883 aa  59.7  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 		 830 aa  59.3  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 872 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  19.1 
 
 		 947 aa  59.3  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>