More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1023 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 869 aa  830    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 886 aa  1824    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 863 aa  770    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  84.2 
 
 		 886 aa  1587    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 863 aa  776    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 865 aa  793    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  97.07 
 
 		 886 aa  1785    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 858 aa  668    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 865 aa  845    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  96.39 
 
 		 886 aa  1778    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 855 aa  829    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 864 aa  803    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 865 aa  773    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 809 aa  701    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 906 aa  1385    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 908 aa  589  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 905 aa  587  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 896 aa  581  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 928 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 892 aa  557  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 816 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 802 aa  532  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 808 aa  529  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 808 aa  519  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 771 aa  487  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 864 aa  484  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 881 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 884 aa  482  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 806 aa  482  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 880 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 799 aa  481  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 881 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 880 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 799 aa  474  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 799 aa  474  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 892 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 865 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 799 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 874 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 885 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 882 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 865 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 880 aa  466  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 883 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 866 aa  458  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 881 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 879 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 886 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 883 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 906 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 883 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 874 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 894 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 882 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 881 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 881 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 887 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 883 aa  446  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 881 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 845 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 881 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 881 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 881 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.46 
 
 		 846 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 879 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 881 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 881 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 881 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 881 aa  439  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 883 aa  438  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 876 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 876 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 867 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.34 
 
 		 858 aa  438  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  31.24 
 
 		 861 aa  439  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 887 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 876 aa  433  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 881 aa  435  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 881 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.49 
 
 		 836 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 885 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 855 aa  433  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 885 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 871 aa  436  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 877 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 881 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  30.66 
 
 		 916 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 891 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 901 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 876 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 894 aa  432  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 886 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.51 
 
 		 886 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 879 aa  428  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 860 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 884 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 892 aa  429  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 884 aa  426  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>