More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1404 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 938 aa  639    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 966 aa  746    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 926 aa  1180    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 969 aa  647    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  59.98 
 
 		 924 aa  1162    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 962 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 932 aa  1938    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 955 aa  687    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 955 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 952 aa  668    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 955 aa  684    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 950 aa  765    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 955 aa  697    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 925 aa  1210    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 926 aa  1197    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 939 aa  628  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 945 aa  624  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 945 aa  618  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 945 aa  611  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 946 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 944 aa  601  1e-170  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 983 aa  601  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 977 aa  599  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 938 aa  516  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.91 
 
 		 934 aa  504  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.16 
 
 		 1094 aa  376  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  28.75 
 
 		 1114 aa  347  6e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  28.56 
 
 		 1062 aa  336  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  26.67 
 
 		 1093 aa  336  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  27.47 
 
 		 1086 aa  325  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 819 aa  184  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 		 826 aa  180  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 876 aa  165  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 876 aa  165  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 886 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  22.62 
 
 		 886 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 		 819 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 		 800 aa  159  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 856 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  21.6 
 
 		 882 aa  159  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 881 aa  158  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  22.24 
 
 		 886 aa  158  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 		 882 aa  156  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 881 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 881 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 881 aa  153  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 880 aa  153  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  21.64 
 
 		 876 aa  152  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 881 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 881 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 881 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  22.62 
 
 		 880 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 		 881 aa  152  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 881 aa  151  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 881 aa  151  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  21.2 
 
 		 865 aa  151  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 881 aa  151  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  21.2 
 
 		 865 aa  150  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 		 894 aa  150  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  22.31 
 
 		 879 aa  150  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  21.1 
 
 		 880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  22.02 
 
 		 874 aa  149  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  21.46 
 
 		 885 aa  149  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 882 aa  148  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  21.66 
 
 		 879 aa  148  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  21.45 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 857 aa  147  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  20.1 
 
 		 881 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 891 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 872 aa  145  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 881 aa  145  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 874 aa  144  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 977 aa  144  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 		 859 aa  144  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 866 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 902 aa  143  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 838 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 977 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  22.81 
 
 		 892 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 		 880 aa  141  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  22.04 
 
 		 872 aa  141  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  22.3 
 
 		 883 aa  141  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  20.11 
 
 		 880 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 		 1068 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  22.49 
 
 		 882 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  21.38 
 
 		 886 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 867 aa  138  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  23.02 
 
 		 977 aa  138  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 909 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  21.24 
 
 		 883 aa  138  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  21.61 
 
 		 907 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 909 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 906 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  21.52 
 
 		 906 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 833 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  22.8 
 
 		 1049 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  21.45 
 
 		 918 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  20.97 
 
 		 881 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  20.84 
 
 		 879 aa  135  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21513  predicted protein  22.88 
 
 		 1035 aa  134  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>