More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0203 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.09 
 
 		 934 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 944 aa  819    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 955 aa  674    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  80.51 
 
 		 946 aa  1607    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 966 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  81.06 
 
 		 945 aa  1626    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 983 aa  638    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 938 aa  805    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 952 aa  664    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 939 aa  640    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 925 aa  677    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 926 aa  649    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 962 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 955 aa  670    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 945 aa  1919    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 955 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 950 aa  692    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 955 aa  721    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 938 aa  745    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  86.77 
 
 		 945 aa  1734    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 926 aa  669    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 924 aa  631  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 977 aa  628  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 932 aa  624  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 969 aa  618  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.14 
 
 		 1094 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  30.42 
 
 		 1062 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  29.63 
 
 		 1093 aa  369  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  29 
 
 		 1086 aa  356  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  31.74 
 
 		 1114 aa  347  8e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 829 aa  187  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 823 aa  174  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 818 aa  169  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 852 aa  167  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 827 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  23.39 
 
 		 906 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 		 863 aa  157  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  22.87 
 
 		 886 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 886 aa  154  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 886 aa  154  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 824 aa  144  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 857 aa  143  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 829 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 824 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 865 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 824 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 863 aa  141  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 858 aa  141  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 825 aa  141  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.1 
 
 		 891 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 826 aa  139  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 835 aa  139  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 		 882 aa  137  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 853 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 859 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 886 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 829 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 874 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 838 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 881 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 819 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 859 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 874 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 874 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 859 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 933 aa  135  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 864 aa  135  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 804 aa  134  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 859 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 831 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 828 aa  134  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 829 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 859 aa  134  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 805 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 863 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 877 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 829 aa  134  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 906 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 872 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 805 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 908 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 908 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 859 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 607 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 819 aa  133  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 808 aa  133  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 830 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 		 1031 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 859 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 827 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 884 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 872 aa  132  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 848 aa  132  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 871 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 802 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 815 aa  131  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0349  leucyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 865 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 817 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 		 905 aa  131  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 865 aa  131  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>