More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0671 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
860 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
860 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
819 aa  854    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
813 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
824 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
868 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
925 aa  796    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
858 aa  937    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
804 aa  889    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
887 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
863 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
859 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
802 aa  908    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
863 aa  675    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
833 aa  975    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
859 aa  685    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41 
 
 
868 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
802 aa  905    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
802 aa  907    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
801 aa  679    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
802 aa  905    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
878 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
969 aa  849    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
806 aa  866    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
868 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
817 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
906 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
830 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
862 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
954 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
873 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
872 aa  724    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
856 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
819 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
868 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
851 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
827 aa  666    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
805 aa  825    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
884 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 
805 aa  870    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
875 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
824 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
829 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
877 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
802 aa  905    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
856 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
865 aa  729    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
866 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
804 aa  758    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
823 aa  697    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
829 aa  705    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
949 aa  840    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
1064 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
813 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
864 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
906 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
862 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
859 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
825 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
954 aa  775    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
872 aa  653    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
856 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  54.36 
 
 
879 aa  996    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1176  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
894 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
861 aa  661    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
971 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
819 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
874 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
805 aa  862    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
971 aa  868    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
870 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
921 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
816 aa  641    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
816 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
860 aa  667    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
894 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
859 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
859 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
864 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
872 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
824 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
805 aa  862    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
829 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
873 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
829 aa  947    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
829 aa  870    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
804 aa  890    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
808 aa  885    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
833 aa  1000    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
843 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
856 aa  657    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
874 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
859 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
859 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
832 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
816 aa  833    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
904 aa  709    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
864 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
971 aa  868    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
859 aa  676    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>