More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1356 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 946 aa  658    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 955 aa  866    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 926 aa  743    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 932 aa  734    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 983 aa  669    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 955 aa  861    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 966 aa  1418    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 945 aa  662    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 939 aa  706    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 925 aa  774    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 955 aa  765    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 924 aa  741    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 962 aa  1994    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 969 aa  861    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 952 aa  845    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 926 aa  734    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 950 aa  1222    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 955 aa  860    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 945 aa  643    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 977 aa  668    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 945 aa  652    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 944 aa  629  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 938 aa  622  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 938 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  31.27 
 
 		 934 aa  504  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  29.37 
 
 		 1114 aa  410  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  28.8 
 
 		 1086 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.84 
 
 		 1094 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.27 
 
 		 1062 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  27.33 
 
 		 1093 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 819 aa  207  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  23.17 
 
 		 882 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 883 aa  194  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 		 881 aa  189  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 865 aa  188  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 865 aa  188  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 886 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 869 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 886 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 886 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 864 aa  180  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 885 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 886 aa  179  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.14 
 
 		 881 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23.23 
 
 		 880 aa  174  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  22.42 
 
 		 882 aa  172  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 892 aa  171  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 874 aa  170  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  22.45 
 
 		 879 aa  169  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 		 879 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 		 911 aa  168  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 881 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  21.77 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 866 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 		 891 aa  166  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 870 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 879 aa  164  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  21.82 
 
 		 879 aa  164  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 881 aa  163  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 918 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 		 874 aa  162  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 881 aa  162  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 906 aa  162  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 881 aa  162  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 881 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 		 918 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  22.35 
 
 		 880 aa  161  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 881 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 881 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 881 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 1049 aa  160  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 881 aa  160  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 881 aa  160  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  22.46 
 
 		 883 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 881 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  22.55 
 
 		 929 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 884 aa  158  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 		 881 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 825 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 		 909 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 980 aa  156  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  22.72 
 
 		 880 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 857 aa  155  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 		 880 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  22.17 
 
 		 883 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  22.72 
 
 		 868 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 1033 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 876 aa  153  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 908 aa  154  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 876 aa  153  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 876 aa  153  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  21.82 
 
 		 880 aa  152  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  22.09 
 
 		 880 aa  152  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  22.21 
 
 		 1068 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  22.06 
 
 		 881 aa  151  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 880 aa  151  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  23.16 
 
 		 1089 aa  150  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  21.76 
 
 		 802 aa  150  9e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  22.04 
 
 		 883 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>