More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1960 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 944 aa  641    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 946 aa  650    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 966 aa  678    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 945 aa  638    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 945 aa  642    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 962 aa  669    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 939 aa  793    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 950 aa  714    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 938 aa  662    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 977 aa  672    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 945 aa  637    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 983 aa  2014    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 955 aa  631  1e-179  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 955 aa  625  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 952 aa  625  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 955 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 955 aa  622  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 925 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 926 aa  612  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 926 aa  599  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 932 aa  601  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 924 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 938 aa  567  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 969 aa  553  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.03 
 
 		 934 aa  532  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  30.55 
 
 		 1114 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.91 
 
 		 1094 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.67 
 
 		 1062 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  28.8 
 
 		 1086 aa  361  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  28.75 
 
 		 1093 aa  345  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  25.03 
 
 		 882 aa  191  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 918 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 		 947 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 		 823 aa  174  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 		 918 aa  172  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 		 918 aa  172  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 876 aa  171  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 881 aa  170  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 933 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 933 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 		 911 aa  168  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 925 aa  167  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 		 876 aa  167  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 		 876 aa  167  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 865 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 865 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2572  valyl-tRNA synthetase  22.98 
 
 		 884 aa  166  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00293466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  21.7 
 
 		 824 aa  166  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 		 881 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 809 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 		 881 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 		 881 aa  164  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 881 aa  163  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 914 aa  162  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 881 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  23.8 
 
 		 918 aa  162  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 881 aa  160  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  23.27 
 
 		 879 aa  160  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 891 aa  160  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 880 aa  160  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  23.04 
 
 		 879 aa  160  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 866 aa  160  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  23.8 
 
 		 886 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 881 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 823 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 881 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 881 aa  159  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 881 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 881 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 885 aa  158  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  21.6 
 
 		 884 aa  158  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  22.92 
 
 		 880 aa  158  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 874 aa  157  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 		 886 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 824 aa  157  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 909 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 867 aa  155  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  23.22 
 
 		 881 aa  155  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  21.73 
 
 		 879 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 894 aa  154  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  21.96 
 
 		 829 aa  154  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 892 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  22.33 
 
 		 933 aa  153  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  23.65 
 
 		 886 aa  151  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  21.69 
 
 		 909 aa  150  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 		 879 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 897 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 		 884 aa  147  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  21.29 
 
 		 819 aa  147  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  22.56 
 
 		 817 aa  147  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 874 aa  146  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  21.51 
 
 		 824 aa  146  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  22.15 
 
 		 909 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 		 855 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 		 881 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1535  valyl-tRNA synthetase  20.58 
 
 		 853 aa  144  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 		 909 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 977 aa  144  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  22.45 
 
 		 877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 824 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>