More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01290 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  49.77 
 
 		 1062 aa  1035    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 1114 aa  2315    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  41.11 
 
 		 1094 aa  834    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  40.34 
 
 		 1086 aa  766    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  46.86 
 
 		 1093 aa  1050    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 977 aa  456  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 950 aa  432  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 966 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 962 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 983 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 955 aa  404  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 955 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 955 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 938 aa  398  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 955 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 952 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 939 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 925 aa  383  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 946 aa  381  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 944 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 945 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 926 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 926 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 969 aa  355  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 945 aa  347  5e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 932 aa  347  7e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 924 aa  342  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 945 aa  340  7e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 938 aa  332  4e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  25.55 
 
 		 934 aa  296  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  20.95 
 
 		 865 aa  83.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  20.84 
 
 		 865 aa  82.4  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  22.3 
 
 		 968 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  22.23 
 
 		 954 aa  81.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  21.89 
 
 		 882 aa  80.9  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  21.98 
 
 		 972 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  22.05 
 
 		 866 aa  78.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 879 aa  77.4  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  21.48 
 
 		 947 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 877 aa  76.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 909 aa  75.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 891 aa  75.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  21.45 
 
 		 874 aa  75.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 861 aa  72  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 874 aa  71.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 896 aa  71.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3757  isoleucyl-tRNA synthetase  19.52 
 
 		 925 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 880 aa  71.2  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 1137 aa  71.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 884 aa  70.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 872 aa  70.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 		 894 aa  70.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  21.52 
 
 		 1031 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1535  valyl-tRNA synthetase  21.83 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 883 aa  68.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 881 aa  68.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 928 aa  68.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  22.08 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3650  isoleucyl-tRNA synthetase  19.83 
 
 		 925 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000233753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 880 aa  67.4  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 883 aa  67.4  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 883 aa  67.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 1061 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 1091 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 		 873 aa  67  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  23.48 
 
 		 886 aa  67.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 		 809 aa  66.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  22.06 
 
 		 977 aa  66.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  24.16 
 
 		 823 aa  66.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  19.79 
 
 		 1042 aa  65.9  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 1060 aa  65.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  20.08 
 
 		 881 aa  65.1  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 911 aa  65.1  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  21.41 
 
 		 1086 aa  65.1  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2053  valyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0948742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  21.78 
 
 		 909 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 1060 aa  64.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 879 aa  64.3  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 880 aa  64.3  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 880 aa  64.3  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  21.21 
 
 		 977 aa  64.3  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 		 829 aa  64.3  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 933 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 908 aa  63.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 819 aa  63.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 891 aa  63.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0970  isoleucyl-tRNA synthetase  21.21 
 
 		 1072 aa  63.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.853285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0985  isoleucyl-tRNA synthetase  22.02 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 1002 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1569  valyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 		 1051 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 		 808 aa  62.4  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>