More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3319 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 
892 aa  1209    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
928 aa  1891    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  84.81 
 
 
896 aa  1610    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 
908 aa  1249    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 
905 aa  1233    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
886 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
886 aa  593  1e-168  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
886 aa  592  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
865 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
906 aa  586  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
886 aa  582  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
802 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
865 aa  571  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
808 aa  567  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
864 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
865 aa  562  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
855 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
858 aa  553  1e-156  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
863 aa  555  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
809 aa  552  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
881 aa  551  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
864 aa  540  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
869 aa  537  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.94 
 
 
846 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
863 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
876 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  36.63 
 
 
861 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  38.06 
 
 
858 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
877 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
906 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  38.58 
 
 
836 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.59 
 
 
886 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
903 aa  515  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 
894 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
885 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
895 aa  505  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
902 aa  505  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
845 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
872 aa  502  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
816 aa  496  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  35.04 
 
 
925 aa  491  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
873 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  35.44 
 
 
916 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
855 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
901 aa  485  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
860 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
911 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 
862 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
808 aa  468  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
871 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
883 aa  436  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
881 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
881 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
882 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
880 aa  429  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
882 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
865 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
865 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 
884 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
881 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
874 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
771 aa  416  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
881 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
891 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
883 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
885 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
879 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
879 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
806 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
880 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
880 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
883 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
799 aa  406  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
885 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
799 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
799 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 
897 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
799 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
867 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 
887 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 
880 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
880 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
886 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 
866 aa  395  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
909 aa  392  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
886 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 
892 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
888 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 
929 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
886 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 
880 aa  393  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
888 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 
887 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  33 
 
 
881 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
881 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 
874 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
881 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
884 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
881 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
881 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>