More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1536 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 908 aa  1862    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 928 aa  1236    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  68.29 
 
 		 896 aa  1273    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  71.41 
 
 		 905 aa  1352    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  68.34 
 
 		 892 aa  1207    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 886 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 886 aa  595  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 886 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 886 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 865 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 906 aa  586  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 864 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 808 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 802 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 865 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 865 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 855 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 863 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 864 aa  550  1e-155  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 869 aa  552  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 809 aa  550  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 863 aa  534  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 858 aa  531  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 876 aa  522  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  36.22 
 
 		 861 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.13 
 
 		 846 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 816 aa  500  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 881 aa  502  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 894 aa  502  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  38.74 
 
 		 836 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 903 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 877 aa  495  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.95 
 
 		 886 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.98 
 
 		 858 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 845 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 860 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 906 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 855 aa  480  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 885 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.72 
 
 		 916 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 895 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  34.31 
 
 		 925 aa  468  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 902 aa  469  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 901 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 872 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 873 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 808 aa  458  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 862 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 911 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 877 aa  449  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 871 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 882 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 883 aa  432  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 880 aa  432  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 885 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 881 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 881 aa  426  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 799 aa  419  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 891 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 880 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 806 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 880 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 881 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 874 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 881 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 883 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 884 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 892 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 883 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 880 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 799 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 865 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 865 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 880 aa  405  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 882 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 883 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 880 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 771 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 879 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 799 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 886 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 799 aa  397  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 888 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 867 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 888 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 886 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 879 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 866 aa  396  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 881 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 897 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 884 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 881 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 909 aa  389  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 881 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 881 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 881 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 881 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 881 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 909 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 881 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>