More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1936 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 911 aa  1026    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 		 862 aa  1104    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 895 aa  1071    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 902 aa  1108    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 		 885 aa  1068    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 894 aa  1082    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 906 aa  1146    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 881 aa  1805    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.06 
 
 		 886 aa  1161    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  81.47 
 
 		 858 aa  1418    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  58.58 
 
 		 925 aa  1009    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 855 aa  912    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 		 877 aa  1162    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  68.1 
 
 		 903 aa  1163    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 845 aa  1194    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  72.2 
 
 		 836 aa  1206    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  67.13 
 
 		 861 aa  1155    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 872 aa  1065    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  72.75 
 
 		 846 aa  1239    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 		 876 aa  1197    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 901 aa  1113    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 873 aa  1068    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  66.23 
 
 		 860 aa  1127    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 871 aa  1079    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.6 
 
 		 916 aa  1112    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 808 aa  607  9.999999999999999e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 802 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 864 aa  595  1e-168  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 905 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 892 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 908 aa  502  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 855 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 865 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 869 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 864 aa  459  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 906 aa  450  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 863 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 865 aa  443  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 886 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 886 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 886 aa  435  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 809 aa  436  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 886 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 863 aa  432  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 858 aa  426  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 799 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 799 aa  404  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 799 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 799 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 816 aa  388  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 806 aa  383  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 808 aa  378  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 877 aa  374  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 771 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 903 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 882 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 904 aa  304  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 893 aa  303  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 912 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 881 aa  303  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 882 aa  302  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 882 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 903 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 905 aa  298  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 865 aa  298  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 865 aa  297  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 906 aa  296  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 880 aa  294  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 882 aa  294  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 881 aa  294  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  28.56 
 
 		 947 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 881 aa  293  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 900 aa  293  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4694  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 906 aa  293  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 952 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 		 1006 aa  291  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 972 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 897 aa  291  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2053  valyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 884 aa  290  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0948742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 1002 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 883 aa  290  9e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 872 aa  290  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 885 aa  289  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 909 aa  289  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 911 aa  289  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 947 aa  289  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 902 aa  288  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 908 aa  287  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 968 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 908 aa  287  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 880 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 909 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 947 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 877 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 883 aa  286  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 957 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>