More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0802 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
983 aa  714    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
944 aa  640    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
946 aa  686    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
925 aa  801    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 
966 aa  1231    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
945 aa  692    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
952 aa  843    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
939 aa  714    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
932 aa  765    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
924 aa  818    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
926 aa  759    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
955 aa  859    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 
962 aa  1222    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
969 aa  823    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
945 aa  705    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
950 aa  1961    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
938 aa  664    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
955 aa  859    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
977 aa  714    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
955 aa  787    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
945 aa  692    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
926 aa  802    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
955 aa  863    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
938 aa  629  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  31.85 
 
 
934 aa  533  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  31.87 
 
 
1094 aa  438  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  30.82 
 
 
1114 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  29.6 
 
 
1086 aa  412  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  28.88 
 
 
1093 aa  404  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.180123 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  27.85 
 
 
1062 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 
881 aa  207  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
882 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  24.19 
 
 
865 aa  195  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 
865 aa  193  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 
880 aa  188  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 
874 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 
881 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 
882 aa  185  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 
883 aa  184  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  23.3 
 
 
874 aa  183  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 
855 aa  182  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 
880 aa  181  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 
891 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 
865 aa  179  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 
879 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 
886 aa  177  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 
809 aa  177  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 
856 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 
879 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 
886 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 
880 aa  175  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 
866 aa  174  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 
885 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 
881 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 
886 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
858 aa  172  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 
880 aa  172  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 
879 aa  171  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  26 
 
 
838 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 
918 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  23.63 
 
 
911 aa  168  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
867 aa  168  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 
863 aa  167  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
886 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 
864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 
904 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
925 aa  166  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 
909 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  22.64 
 
 
865 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
883 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 
883 aa  163  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 
907 aa  163  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 
869 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  21.87 
 
 
933 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  21.87 
 
 
933 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  21.77 
 
 
880 aa  159  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 
909 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 
909 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  22.34 
 
 
892 aa  157  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  21.82 
 
 
880 aa  158  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  21.79 
 
 
883 aa  157  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 
908 aa  157  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  22.49 
 
 
933 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 
880 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  23.07 
 
 
906 aa  156  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  21.83 
 
 
884 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  21.52 
 
 
881 aa  154  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  23.04 
 
 
881 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 
917 aa  153  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 
921 aa  153  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  22.09 
 
 
947 aa  153  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 
918 aa  153  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 
905 aa  153  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 
881 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  22.27 
 
 
947 aa  152  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 
881 aa  152  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 
881 aa  152  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 
881 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 
881 aa  151  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 
872 aa  150  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.180306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>