More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1246 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.66 
 
 		 934 aa  670    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 944 aa  832    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 945 aa  1606    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 955 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 955 aa  670    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 966 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 925 aa  670    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 939 aa  644    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 938 aa  739    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 926 aa  651    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 926 aa  664    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  79.03 
 
 		 946 aa  1591    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 962 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  86.77 
 
 		 945 aa  1734    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 983 aa  637    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 952 aa  655    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 950 aa  692    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 955 aa  668    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 945 aa  1928    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 955 aa  732    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 938 aa  815    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 924 aa  632  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 977 aa  634  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 969 aa  619  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 932 aa  611  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  30.56 
 
 		 1094 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  29.75 
 
 		 1062 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  30.5 
 
 		 1093 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  28.51 
 
 		 1086 aa  350  6e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  30.37 
 
 		 1114 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  24.97 
 
 		 829 aa  180  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 827 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 863 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 865 aa  148  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 		 906 aa  147  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 865 aa  143  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 824 aa  142  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 835 aa  141  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 824 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 825 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 859 aa  138  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 823 aa  138  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 874 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 859 aa  137  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 859 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 874 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 826 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 874 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 607 aa  137  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 864 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 859 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 872 aa  135  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 857 aa  135  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 859 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 824 aa  135  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 829 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 863 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 859 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 829 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 852 aa  133  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 863 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 810 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 819 aa  133  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 		 881 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 829 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 860 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 830 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0990  leucyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 858 aa  132  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 821 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 821 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 859 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 815 aa  131  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 857 aa  131  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 863 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 828 aa  131  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 831 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 865 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 868 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 819 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1984  leucyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 841 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000675596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 851 aa  129  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  23.39 
 
 		 1031 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 872 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 908 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  22.5 
 
 		 908 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 805 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 829 aa  128  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 802 aa  128  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0349  leucyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 865 aa  127  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 802 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 802 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 802 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 802 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1045  leucyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 809 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2911  leucyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 832 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.084861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 859 aa  127  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 829 aa  127  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 802 aa  127  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>