More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0929 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
1076 aa  1167    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
1053 aa  835    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
1037 aa  664    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
980 aa  687    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
1033 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
1033 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
1033 aa  830    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
1033 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
1046 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
1033 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
977 aa  647    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
1033 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000414459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
1058 aa  1358    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
1066 aa  790    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
1034 aa  858    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
1089 aa  900    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
975 aa  712    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
1068 aa  939    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
1062 aa  1190    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
1033 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
1049 aa  662    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
1033 aa  641    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 
1058 aa  1331    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
1049 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
1040 aa  874    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
1068 aa  682    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
1070 aa  947    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
1039 aa  684    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
1039 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
1033 aa  645    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
1091 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
977 aa  669    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1049 aa  2157    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
1024 aa  685    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
1060 aa  1154    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
1050 aa  971    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
1062 aa  910    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
1034 aa  866    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
977 aa  644    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
1068 aa  957    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 
1059 aa  1184    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
1034 aa  865    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
1066 aa  1131    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
1033 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
1033 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
1042 aa  624  1e-177  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
1100 aa  620  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
1085 aa  621  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
1080 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
991 aa  614  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
1066 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
1077 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
1061 aa  610  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
1050 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
1089 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
1083 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
1075 aa  608  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
1069 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
1086 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
1054 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
1031 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
1079 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
1014 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
1081 aa  592  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
1108 aa  591  1e-167  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
1069 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
1014 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
1084 aa  588  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
1014 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
1059 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
1110 aa  582  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
1066 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
1080 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
1129 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
1048 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
1073 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
1060 aa  571  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 
1135 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
1091 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 
1134 aa  564  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
1133 aa  564  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 
1056 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
1082 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0044  isoleucyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
1148 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
1036 aa  558  1e-157  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
1093 aa  558  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00705  isoleucyl-tRNA synthetase ,cytoplasmic (AFU_orthologue; AFUA_1G13710)  32.77 
 
 
1077 aa  550  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
920 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4664  isoleucyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
1143 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0311577  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
1091 aa  551  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
919 aa  552  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
1051 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
930 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
919 aa  547  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
931 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
939 aa  545  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
1137 aa  540  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
929 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
926 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
922 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>