More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1197 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
860 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
860 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
819 aa  691    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
813 aa  732    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  43 
 
 
824 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
868 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
858 aa  855    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
804 aa  900    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
860 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
805 aa  862    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
802 aa  882    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
860 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
833 aa  850    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
835 aa  876    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
868 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
802 aa  880    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
802 aa  880    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
801 aa  679    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
802 aa  880    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
906 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
823 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
823 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
868 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  45.78 
 
 
879 aa  770    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
830 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
862 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
820 aa  662    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
802 aa  889    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
872 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
815 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
819 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
868 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
817 aa  666    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
851 aa  691    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
823 aa  770    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
805 aa  772    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
862 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
805 aa  753    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
865 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
824 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
829 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
877 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
802 aa  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
971 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
865 aa  682    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
860 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
804 aa  715    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
820 aa  662    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
829 aa  758    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
806 aa  875    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
858 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
805 aa  862    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
814 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
802 aa  874    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
819 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
857 aa  770    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
817 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
906 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
904 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
860 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
860 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
859 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
859 aa  670    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
856 aa  663    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
819 aa  701    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
825 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
971 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
817 aa  718    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
816 aa  724    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
816 aa  741    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
816 aa  755    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
868 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
824 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
824 aa  734    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
807 aa  719    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
864 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
872 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
824 aa  760    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
824 aa  739    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
862 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
826 aa  696    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
829 aa  799    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
829 aa  847    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
804 aa  819    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
808 aa  876    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
833 aa  850    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
843 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
813 aa  725    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
829 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
859 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
838 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
827 aa  709    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
823 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
816 aa  715    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
828 aa  732    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
857 aa  749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
971 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
860 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
819 aa  728    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
864 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>