More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2156 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 860 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 860 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 813 aa  754    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 824 aa  835    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 868 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 858 aa  703    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 804 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 887 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 864 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 856 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 802 aa  735    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 863 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 862 aa  700    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 833 aa  688    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 859 aa  663    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 868 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 802 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 802 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 802 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3450  leucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 864 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345481  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 823 aa  694    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 823 aa  692    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 868 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 921 aa  649    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 876 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 830 aa  1711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 862 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 825 aa  848    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 857 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0091  leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 883 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 872 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 913 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 819 aa  727    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 868 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 878 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 851 aa  785    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 805 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 884 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3415  leucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 864 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 875 aa  765    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 824 aa  827    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 829 aa  798    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 877 aa  700    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 802 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1572  leucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 822 aa  643    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.940806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 856 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 865 aa  768    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 866 aa  692    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 862 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 829 aa  840    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 863 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 858 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0385  leucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.039423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 848 aa  665    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 829 aa  803    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 819 aa  695    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 882 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 817 aa  707    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 864 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 863 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 872 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0436  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 878 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 859 aa  752    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 878 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 934 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2973  leucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 873 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 861 aa  649    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 856 aa  793    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 819 aa  760    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 859 aa  676    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 817 aa  724    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 874 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 817 aa  799    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 870 aa  688    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 871 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 816 aa  732    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 816 aa  744    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 860 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 929 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 859 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 859 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 864 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 872 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 824 aa  860    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 865 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 864 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 873 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 829 aa  641    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 829 aa  683    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 804 aa  708    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 808 aa  720    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 833 aa  697    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 843 aa  1169    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 856 aa  665    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 829 aa  773    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 859 aa  709    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 859 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  72.47 
 
 		 832 aa  1224    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0731  leucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 811 aa  638    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.231189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 823 aa  806    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>